Разница между кДНК и геномной библиотекой

Ключевая разница - кДНК против геномной библиотеки
 

Существует два основных типа библиотек ДНК, созданных учеными с использованием методов генной инженерии. Это библиотека кДНК и библиотека генома. ключевое отличие между кДНК и геномной библиотекой является то, что Библиотека кДНК содержит клонированную комплементарную ДНК общей мРНК организма, а библиотека геномной ДНК содержит клонированные фрагменты всего генома организма.. Библиотека геномной ДНК больше, чем библиотека кДНК.

СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое библиотека кДНК
3. Что такое геномная библиотека
4. Сравнение бок о бок - кДНК против геномной библиотеки
5. Резюме

Что такое геномная библиотека?

Библиотека геномной ДНК - это коллекция клонов, содержащих фрагменты общей геномной ДНК организма. Он содержит всю геномную ДНК этого организма, включая кодирующие и некодирующие последовательности. Конструирование геномной библиотеки осуществляется с помощью технологии рекомбинантных ДНК с последующим клонированием (генная инженерия). Существуют различные этапы построения, как показано на рисунке 01. Процесс начинается с выделения геномной ДНК. Используя подходящий протокол выделения ДНК, следует выделить общую геномную ДНК организма. Затем ДНК должна быть преобразована в контролируемые размеры или в конкретные фрагменты с помощью эндонуклеаз рестрикции (ферментов, резающих ДНК). Фрагментированная ДНК должна быть вставлена ​​в векторы с использованием ДНК-лигаз (ферментов, соединяющих ДНК). Вектор - самовоспроизводящийся организм. Плазмиды и бактериофаги являются обычно используемыми векторами в технологии рекомбинантных ДНК. Эти лигированные векторы известны как молекулы рекомбинантных ДНК, поскольку они несут как собственные, так и встроенные последовательности ДНК. Рекомбинантные векторы добавляются к бактерии-хозяину и превращаются в поглощающие рекомбинантные векторы внутри бактериальной клетки. Бактерии с рекомбинантными векторами (плазмидами) следует выращивать в культуральной среде. Во время размножения бактерий бактериальная ДНК вместе с рекомбинантными плазмидами реплицирует свои геномы и продуцирует клоны. Эти клоны содержат весь геном исходного организма. Следовательно, это называется геномная библиотека. Плазмиды можно легко отделить от бактериальной хромосомной ДНК, чтобы создать геномную библиотеку этого организма. Если конкретный организм содержит интересующие гены, его легко обнаружить в геномной библиотеке путем гибридизации с использованием молекулярных зондов (маркеров)..

Геномные библиотеки важны для изучения структуры и функции генома, конкретных генов, местоположения генов, картирования генов, мутаций, секвенирования генов, идентификации новых терапевтических генов и т. Д..

Рисунок_1: Построение геномной библиотеки

Что такое библиотека кДНК?

Библиотека кДНК представляет собой набор клонов комплементарной ДНК (кДНК), синтезированных из общей мРНК организма. Процедура строительства включает в себя различные этапы. Очистка общей мРНК из организма является первым шагом. Выделенная мРНК превращается в цепи кДНК с помощью процесса, называемого обратной транскрипцией. Обратной транскрипции способствует фермент, называемый обратной транскриптазой. Он использует небольшой 3 'праймер и инициирует синтез первой цепи кДНК, комплементарной цепи матричной мРНК. Полученные двухцепочечные кДНК превращают в более мелкие фрагменты с помощью эндонуклеаз рестрикции и встраивают в подходящие векторы. Эти сконструированные рекомбинантные молекулы затем добавляют в организм хозяина и выращивают в культуральной среде для получения клонов. Коллекция клонов, содержащих фрагменты кДНК организма, называется библиотекой кДНК. Полностью нарезанная зрелая мРНК не содержит интронов и регуляторных областей. Поэтому некодирующие фрагменты отсутствуют в библиотеках кДНК в отличие от геномной библиотеки.

библиотеки кДНК важны для анализа кодирующих областей, функций генов, экспрессии генов и т. д..

Рисунок 2: Построение библиотеки кДНК

В чем разница между кДНК и геномной библиотекой?

кДНК против геномной библиотеки
Библиотека кДНК представляет собой набор клонов, несущих комплементарную ДНК к мРНК организма.	Геномная библиотека - это коллекция клонов, несущих общую геномную ДНК организма.
Кодирование против некодирующих последовательностей
библиотека кДНК содержит только кодирующие последовательности; не содержит интронов.	Геномная библиотека состоит из всей геномной ДНК, включая некодирующую (интроны и регуляторную) ДНК.
Размер
библиотека кДНК мала.	Геномная библиотека большая.
Исходный материал
Исходным материалом является мРНК	Исходным материалом является ДНК.
Вовлечение обратной транскрипции.
Обратная транскрипция происходит при синтезе первой цепи кДНК.	Обратной транскрипции не бывает.

Резюме - кДНК и геномная библиотека

Геномная библиотека представляет собой популяцию клонов, несущих фрагментированную общую геномную ДНК организма. Библиотека кДНК представляет популяцию клонов, несущих комплементарную ДНК общей мРНК организма. Клон кДНК содержит только последовательности, найденные в мРНК, в то время как геномный клон содержит последовательности всего генома. В этом разница между кДНК и геномной библиотекой.

Ссылка:
1. Ханиф, Дина Т Кочунни Джазир. «Разница между геномной и кДНК-библиотекой». Разница между геномной и кДНК-библиотекой. Н.п., н.д. Web. 15 февраля 2017
2. Стекел, Дов Дж., Йоав Гит и Франческо Фальчиани. «Сравнение экспрессии генов из нескольких библиотек кДНК». Исследование генома. Лабораторное издательство Cold Spring Harbor, декабрь 2000 г. Веб. 16 февраля 2017
3. «Скрининг геномной библиотеки на гены, участвующие в толерантности к н-бутанолу в Escherichia coli». Скрининг геномной библиотеки для генов, участвующих в толерантности к н-бутанолу в Escherichia coli. Н.п., н.д. Web. 16 февраля 2017

Изображение предоставлено:
1. «Формирование библиотеки кДНК» PhD Dre в Википедии на английском языке (CC BY-SA 3.0) с помощью Commons Wikimedia
2. «Построение геномной библиотеки» по Aluquette - собственная работа (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia