Разница между ходьбой и прыжком хромосомы

Ключевая разница - ходьба с хромосомами против прыжков
 

Хромосомная ходьба и хромосомный прыжок - это два технических инструмента, используемых в молекулярной биологии для определения местоположения генов на хромосомах и физического картирования геномов. Хромосомная ходьба - это метод, используемый для клонирования гена-мишени в геномной библиотеке путем повторного выделения и клонирования смежных клонов геномной библиотеки.. Хромосомный прыжок - это особый вариант хромосомной ходьбы, который преодолевает точки перелома хромосомной ходьбы. Хромосомная ходьба может только упорядочить и отобразить небольшую длину хромосом, в то время как хромосомный прыжок позволяет секвенировать большие части хромосом.. В этом ключевое отличие хромосомной ходьбы от хромосомной ходьбы.

СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое ходьба по хромосомам
3. Что такое хромосомный прыжок
4. Сравнение бок о бок - ходьба хромосом против прыжков
5. Резюме

Что такое ходьба по хромосомам?

Хромосомная ходьба - это инструмент, который исследует неизвестные участки последовательности хромосом, используя перекрывающиеся рестрикционные фрагменты. При ходьбе по хромосоме часть известного гена используется в качестве зонда и продолжается для характеристики полной длины хромосомы, которая должна быть картирована или секвенирована. Это идет от маркера до целевой длины. При ходьбе по хромосомам концы каждого перекрывающегося фрагмента используются для гибридизации для идентификации следующей последовательности.

Зонды получают из концевых частей клонированной ДНК и они субклонируют. Затем они используются для поиска следующего перекрывающегося фрагмента. Все эти перекрывающиеся последовательности используются для построения генетической карты хромосомы и определения местоположения генов-мишеней. Это метод анализа длинных участков ДНК с помощью небольших перекрывающихся фрагментов из реконструированной геномной библиотеки..

Техника Ходьбы Хромосомы - Шаги

1. Выделение фрагмента ДНК, который содержит известный ген или маркер рядом с геном-мишенью

2. Подготовка карты рестрикции выбранного фрагмента и субклонирование концевой области фрагмента для использования в качестве зонда
3. Гибридизация зонда со следующим перекрывающимся фрагментом
4. Подготовка карты рестрикции фрагмента 1 и субклонирование концевой области фрагмента 1 для использования в качестве зонда для идентификации следующего перекрывающегося фрагмента.
5. Гибридизация зонда со следующим перекрывающимся фрагментом 2

6. Подготовка рестрикционной карты фрагмента 2 и субклонирование концевой области фрагмента 2 в качестве зонда для идентификации следующего перекрывающегося фрагмента

Вышеуказанные шаги должны быть продолжены до целевого гена или до 3 'конца общей длины последовательности.

Рисунок 01: Техника ходьбы по хромосомам

Хромосомная ходьба является важным цитогенетическим аспектом в обнаружении SNP многих организмов и анализе генетически передаваемых заболеваний и обнаружении мутаций соответствующих генов..

Что такое хромосома?

Хромосомный прыжок - это метод, используемый в молекулярной биологии для физического картирования геномов организмов. Этот метод был введен для преодоления барьера хромосомной ходьбы, который возник при обнаружении повторяющихся участков ДНК в процессе клонирования. Поэтому технику хромосомного прыжка можно рассматривать как особый вариант хромосомной ходьбы. Это быстрый метод по сравнению с хромосомной ходьбой и позволяет обходить повторяющиеся последовательности ДНК, которые не склонны клонироваться во время хромосомной ходьбы. Хромосомный скачок сужает разрыв между геном-мишенью и доступными известными маркерами для картирования генома.

Хромосомный инструмент для прыжков начинается с разрезания специфической ДНК с помощью специальных рестрикционных эндонуклеаз и лигирования фрагментов в циклические петли. Затем праймер, разработанный из известной последовательности, используют для упорядочения циклических петель. Этот праймер позволяет прыгать и секвенировать альтернативным способом. Следовательно, он может обходить повторяющиеся последовательности ДНК и быстро проходить через хромосому для поиска целевого гена.

Открытие гена, кодирующего болезнь муковисцидоза, было сделано с использованием хромосомного инструмента прыжков. В сочетании друг с другом хромосомный прыжок и ходьба могут улучшить процесс картирования генома.

Рисунок 02: Прыжки по хромосомам

В чем разница между ходьбой и прыжками хромосом?

Хромосома Ходьба против Прыжков
Хромосома - это инструмент, используемый в молекулярной биологии для картирования генома и определения местоположения определенных генов..	Хромосомный прыжок - инструмент, используемый для физического картирования геномов и быстрого нахождения генов-мишеней в хромосомах..
Сравнительная длина секвенирования
Только небольшие фрагменты могут быть клонированы путем хромосомной ходьбы.	Большие длины хромосом могут быть картированы хромосомным прыжком.
Клонирование повторяющейся ДНК в хромосомах
Технику ходьбы по хромосомам трудно пройти по повторяющимся последовательностям ДНК, найденным в хромосомах..	Это позволяет обходить повторяющиеся последовательности ДНК. Поэтому нет никаких проблем, когда находит их во время последовательности.
Факторы, влияющие на процессы
Успех процесса зависит от размера генома и расстояния, которое необходимо «пройти» от известного геномного положения к желаемому гену.	Успех не зависит от размера генома на расстоянии от маркера до цели.
Эффекты неклонированной ДНК
Хромосомная ходьба может быть остановлена ​​неклонированными фрагментами ДНК.	Самая низкая нота, которую могут сыграть в пикколо - D4.
Нужна известная последовательность
Процесс начинается с известного гена рядом с мишенью.	Процесс требует известного фрагмента для проектирования учебника для начинающих.

Резюме - Хромосома Ходьба против Прыжков

Хромосомную ходьбу часто применяют, когда известно, что конкретный ген расположен рядом с ранее клонированным геном в хромосоме, и его можно идентифицировать с повторным выделением соседних геномных клонов из геномной библиотеки. Однако, когда повторяющиеся участки ДНК обнаруживаются во время хромосомной техники ходьбы, процесс не может быть продолжен. Следовательно, техника ломается с этой точки. Хромосомный прыжок является молекулярно-биологическим инструментом, который преодолевает это ограничение для картирования геномов. Он обходит эти повторяющиеся участки ДНК, которые трудно клонировать, и помогает в физическом картировании геномов. Это главное отличие хромосомной ходьбы от прыжков.

Ссылки:
1. Накасеко, Юкинобу, Ясухиса Адачи, Синтичи Фунахаси, Осами Нива и Мицухиро Янагида. «Ходьба по хромосомам показывает очень гомологичную повторяющуюся последовательность, присутствующую во всех центромерных областях делящихся дрожжей». EMBO Journal. Национальная медицинская библиотека США, май 1986 г. 22 марта 2017
2. Тахери, Али. «Хромосома гуляет и прыгает». Достижения в области генной инженерии. OMICS International, 30 октября 2013 г. Интернет. 22 марта 2017