ДНК-лигаза и ДНК-полимераза являются важными ферментами, участвующими в репликации ДНК и механизмах репарации ДНК организмов.. ДНК-лигаза ответственна за соединение фрагментов ДНК, катализируя образование фосфодиэфирных связей между нуклеотидами. ДНК-полимераза отвечает за синтез ДНК из ее строительных блоков (нуклеотидов) с использованием матрицы ДНК. В этом ключевое отличие ДНК-лигазы от ДНК-полимеразы..
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое ДНК-лигаза
3. Что такое ДНК-полимераза
4. Сравнение бок о бок - ДНК-лигаза против ДНК-полимеразы
5. Резюме
ДНК-лигаза является ферментом, который катализирует образование фосфодиэфирной связи между 3 '- ОН и 5'-РО4 групп нуклеотидов и способствует объединению фрагментов ДНК. Это также известно как молекулярный сшиватель. Эта способность позволяет заполнять пробелы или зазубрины ДНК и соединять фрагменты Оказаки, образующиеся во время репликации ДНК. ДНК-лигазы очень полезны в технологии рекомбинантных ДНК для получения молекул рекомбинантных ДНК. ДНК-лигаза соединяет интересующую ДНК с векторной ДНК. Следовательно, это важный фермент для организмов..
Фермент ДНК-лигаза зависит от кофактора и Mg2+ ионы для его функции. Есть два кофактора, которые помогают в ДНК-лигазах. NAD+ действует как кофактор для бактериальных ДНК-лигаз, в то время как АТФ часто действует как кофакторный вирус и эукариотические ДНК-лигазы. Эукариотическая ДНК-лигаза действует через три основных этапа.
Шаг 01. ДНК-лигаза атакует молекулу АТФ и высвобождает пирофосфат (две фосфатные группы) и АМФ и образует лигаза-аденилатное промежуточное соединение, ковалентно связываясь с получающимся АМФ.
Шаг 02: Образованный промежуточный фермент AMP переносит AMP к 5 'фосфату никеля и образует ДНК - аденилат (5'-фосфатный кислород цепи ДНК атакует фосфор лигаза-аденилатного промежуточного соединения).
Шаг 03: ДНК-лигаза катализирует атаку 3'-ОН ника на ДНК-аденилат, чтобы присоединиться к полинуклеотидам и высвобождает АМФ.
ДНК-лигазы обычно выделяются из бактериофага Т4 и широко используются в технологии рекомбинантных ДНК.
Рисунок 01: ДНК-лигаза в восстановлении ник
ДНК-полимераза - это повсеместный фермент, присутствующий во всех организмах, участвующих в синтезе ДНК и репликации генома. Генетическая информация передается от родителей к потомству с помощью ДНК-полимераз. Это катализирует синтез новой ДНК, комплементарной для существующей ДНК. ДНК-полимераза добавляет нуклеотиды (строительные блоки нуклеиновых кислот) к 3 'ОН-группе последовательности праймера и продолжает образование цепи в 5' направлении. Большинство ДНК-полимераз обладают 5'-3'-полимеразной активностью и 3'-5'-экзонуклеазной активностью для корректуры.
Прокариотические ДНК-полимеразы описаны в пяти основных группах. Эукариоты содержат не менее 16 различных ДНК-полимераз. Все эти ДНК-полимеразы сгруппированы в семь семейств, а именно: A, B, C, D, X, Y и RT (обратная транскриптаза)..
Рисунок 02: ДНК-полимеразная репликация ДНК
ДНК-лигаза против ДНК-полимеразы | |
ДНК-лигаза - это фермент, который катализирует образование фосфодиэфирных связей между нуклеотидами и соединяет фрагменты ДНК вместе. | ДНК-полимераза - это фермент, который катализирует синтез ДНК с использованием нуклеотидов.. |
Роль в репликации ДНК | |
ДНК-лигаза является дополнительным ферментом в репликации ДНК, который объединяет фрагменты Оказаки. | ДНК-полимераза является основным ферментом в репликации ДНК. |
Требования | |
Зависит от Mg2+ ионы и АТФ / НАД+ кофакторов | Это зависит от матрицы, нуклеотидов, праймеров и Mg2+. |
функции | |
ДНК-лигаза важна для рекомбинации ДНК, репарации ДНК и репликации ДНК. | ДНК-полимераза важна для репликации ДНК, репарации ДНК и технологии рекомбинации ДНК. |
ДНК-лигаза является важным ферментом, который необходим для соединения фрагментов ДНК посредством фосфодиэфирных связей. ДНК-полимераза является основным ферментом, важным для синтеза новой ДНК. Ключевым отличием ДНК-лигазы от ДНК-полимеразы является их функция. Однако оба фермента необходимы для репарации ДНК, репликации ДНК и технологии рекомбинантных ДНК..
Ссылка:
Росси Р., А. Монтекукко, Дж. Сиаррокки и Дж. Бьямонти. «Функциональная характеристика ДНК-лигазы Т4: новое понимание механизма действия». Исследование нуклеиновых кислот. Национальная медицинская библиотека США, 01 июня 1997 г. Интернет. 11 марта 2017
Мартин, Ина В. и Стюарт А. Макнейл. «АТФ-зависимые ДНК-лигазы». Геном Биология. BioMed Central, 2002. Web. 11 марта 2017
Гарсия-Диас, Мигель и Катаржина Бебенек. «Множественные функции ДНК-полимераз». Критические обзоры в науках о растениях. Национальная медицинская библиотека США, март 2007 г. Интернет. 11 марта 2017
Изображение предоставлено:
1. «Механизм восстановления нига Ligase». Автор: Jrmcnall - ChemDraw (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia
2. «Механизм репликации Phage T7». Даникль - собственная работа (CC BY-SA 4.0) через Commons Wikimedia.