Разница между рыбой и CGH

ключевое отличие между FISH и CGH в том, что FISH - это молекулярный метод, который обнаруживает специфическую последовательность ДНК на хромосоме с использованием флуоресцентно меченных зондов, а CGH - еще один метод молекулярной цитогенетики, который обнаруживает изменения в геномной ДНК..

Цитогенетический анализ играет важную роль в медицине при обнаружении хромосомных аномалий, таких как анеуплоидии, делеции, дупликации, перегруппировки и т. Д. Хромосомные аномалии в конечном итоге приводят к генетическим заболеваниям, таким как рак, бесплодие, синдром Дауна, синдром Клайнфелтера, синдром Тернера, лейкемия и т. Д. Существуют различные молекулярно-цитогенетические методы выявления вышеупомянутых дефектов и заболеваний. Среди них FISH (флуоресцентная гибридизация in situ) и CGH (сравнительная геномная гибридизация) являются двумя мощными методами гибридизации. Однако оба метода имеют свои плюсы и минусы.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое РЫБА 
3. Что такое CGH
4. Сходство между FISH и CGH
5. Сравнение бок о бок - FISH против CGH в табличной форме
6. Резюме

Что такое РЫБА?

FISH - это метод гибридизации нуклеиновых кислот, выполняемый на части или участке ткани, во всей ткани или клетках. Это метод на основе зонда. Методика зависит от теории парного комплементарного основания Уотсон-Крика, что приводит к гибридам ДНК-ДНК или гибридов ДНК-РНК, которые, таким образом, могут обнаруживать мутированные гены или идентифицировать интересующий ген. Кроме того, в этом методе используются одноцепочечные последовательности ДНК, двухцепочечные последовательности ДНК, одноцепочечные последовательности РНК или синтетический олигонуклеотид, полученные с использованием трансляции никеля, в качестве зондов, комплементарных интересующим генным последовательностям. Кроме того, наиболее важной особенностью этого метода является маркировка зондов флуоресцентными красителями. Таким образом, зонды связываются с комплементарными частями хромосомы и облегчают обнаружение.

Более того, FISH - это очень чувствительный и специфический метод. Следовательно, это общий метод исследования и диагностики гематологических злокачественных новообразований и солидных опухолей. Но FISH показывает низкое разрешение. Это также требует предварительного знания целевой аномалии для разработки последовательности зондов.

Рисунок 01: РЫБА

Существует множество применений FISH, главным образом в молекулярной диагностике инфекционных заболеваний для выявления наличия патогенных микроорганизмов и подтверждения патогенных микроорганизмов с помощью молекулярной диагностики. Кроме того, FISH является широко используемым методом в области биологии развития, кариотипирования и филогенетического анализа и физического картирования хромосом..

Что такое CGH?

Сравнительная геномная гибридизация (CGH) - еще одна молекулярно-цитогенетическая методика, основанная на ДНК, которая может обнаруживать изменения последовательностей геномной ДНК. Этот метод является усовершенствованным методом, который может анализировать хромосомные и генные модификации, чтобы обнаружить изменения или изменения в последовательностях геномной ДНК. Кроме того, CGH требует выделения и фрагментации ДНК из экспериментального образца и контрольного образца. Затем образцы должны быть помечены с использованием двух разных флуоресцентных красителей (обычно красного и зеленого). Позже оба образца смешиваются и допускаются для конкурентной гибридизации. Заключительным этапом является анализ образцов на предмет изменений ДНК, таких как дупликация генов, потеря генов и т. Д. В частности, он измеряет различия в количестве копий ДНК между тестируемым образцом и контрольным образцом..

Рисунок 02: CGH

Другая версия CGH доступна сейчас; это более продвинутый метод, чем обычный CGH. Это метод, называемый CGH на основе массива или aCGH. aCGH позволяет точно идентифицировать делеции генов или последовательностей во многих тысячах последовательностей в одном эксперименте.

Каковы сходства между FISH и CGH?

• FISH и CGH - две молекулярные техники.
• И FISH, и CGH полагаются на гибридизацию нуклеиновых кислот..
• Кроме того, обе методики нуждаются в разработанных датчиках для обнаружения определенных целей ДНК.
• Мы используем их для внутриутробной и постнатальной диагностики генетических заболеваний..
• Кроме того, FISH и CGH являются очень мощными инструментами для изучения геномных изменений..
• Они используют флуоресцентные красители для маркировки зондов.

В чем разница между FISH и CGH?

РЫБА на месте Процедура гибридизации, которая использует флуоресцентные зонды для обнаружения специфических последовательностей ДНК, в то время как CGH - метод молекулярной гибридизации, который обнаруживает изменения последовательностей геномной ДНК. Таким образом, это ключевое различие между FISH и CGH.

Кроме того, FISH требует предварительного знания целевой аномалии для разработки последовательностей зондов, в то время как CGH не требует предварительных знаний. Кроме того, еще одно различие между FISH и CGH состоит в том, что FISH показывает ограниченное разрешение, в то время как aCGH показывает высокое разрешение..

Приведенная ниже инфографика суммирует разницу между FISH и CGH.

Основная информация - FISH vs CGH

FISH и CGH являются двумя молекулярно-цитогенетическими методами, которые облегчают обнаружение интересующих последовательностей генов. FISH облегчает обнаружение специфической последовательности ДНК в хромосоме с использованием флуоресцентно меченных зондов, в то время как CGH облегчает обнаружение изменений в геномной ДНК. Таким образом, это ключевое различие между FISH и CGH.

Ссылка:

1. «Гибридизация флуоресценции in situ (FISH)» Nature News, издательская группа Nature, доступна здесь.
2. Hester, Susan D, et al. «Сравнение технологий сравнительной геномной гибридизации на платформах микроматриц». Журнал биомолекулярных технологий: JBT, Ассоциация биомолекулярных ресурсов, апрель 2009 г., доступно здесь.

Изображение предоставлено:

1. «Мультиплексный анализ ViewRNA FISH в клетках Jurkat и HeLa» Райан Джеффс - собственная работа (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia
2. «CGH-схема» Автор: Mbaudis (доклад) (загрузка) - собственная работа (CC BY 2.5) через Commons Wikimedia