Разница между прямым и обратным праймером

Ключевая разница - вперед против обратного праймера
 

Полимеразная цепная реакция (ПЦР) - это метод амплификации ДНК, который используется в молекулярно-биологических применениях. Это широко используемая техника, которая делает миллионы или миллиарды копий особенно интересующей последовательности ДНК. Это в пробирке Метод выполнен в лабораториях. Метод ПЦР полностью зависит от коммерчески производимой ДНК-полимеразы, называемой Taq-полимеразой. А также это требует нескольких других компонентов и надлежащего поддержания температуры. Одним из важных компонентов является грунтовка. Праймеры представляют собой короткие последовательности ДНК, специально предназначенные для последовательности ДНК-мишени. Они обычно около 20 нуклеотидов в длину. Taq-полимераза катализирует добавление нуклеотидов в ранее существовавшую нуклеотидную последовательность. Следовательно, праймеры служат отправной точкой синтеза новых цепей. Taq-полимераза работает только в направлении от 5 'до 3', следовательно, синтез ДНК происходит в том же направлении от 5 'до 3'. Поскольку ДНК является двухцепочечной, в ПЦР необходимы два типа праймеров. Они известны как прямой праймер и обратный праймер. Прямой и обратный праймеры называются в зависимости от направления удлинения праймера в ДНК, когда происходит синтез ДНК.. Прямой праймер отжигает антисмысловую цепь ДНК и инициирует синтез + ve цепи гена в направлении от 5 'до 3'. Обратный отжиг праймера с смысловой цепью и инициирует синтез комплементарной цепи кодирующей цепи; который является -в цепочке гена в направлении 5'to 3 '. Это ключевое отличие между прямым и обратным праймерами.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое прямой учебник?
3. Что такое обратный праймер?
4. Сходство между прямым и обратным праймером
5. Сравнение бок о бок - прямой и обратный праймер в табличной форме
6. Резюме

Что такое Forward Primer?

Прямая ориентация - это синтез кодирующей цепи или смысловой цепи гена. Taq-полимераза катализирует синтез новой цепи в направлении от 5 'до 3'. Синтез кодирующей цепи происходит, когда праймер отжигается с некодирующей или антисмысловой цепью и удлиняется в направлении от 5 'до 3'..

Рисунок 01: Прямой и обратный праймеры

Праймер, отжигающий антисмысловую цепь, некодирующую цепь или матричную цепь, известен как прямой праймер, поскольку прямой праймер действует как отправная точка для синтеза кодирующей или положительной цепи гена. Прямой праймер имеет короткую нуклеотидную последовательность, которая комплементарна 3'-фланкирующему концу антисмысловой цепи. Он гибридизуется с антисмысловой цепью и способствует Taq-полимеразе для добавления нуклеотидов, комплементарных матричной цепи..

Что такое обратный праймер??

Обратный праймер - это короткая последовательность ДНК, отжигающая 3'-конец смысловой цепи или кодирующей цепи. Обратный праймер служит отправной точкой для синтеза комплементарной цепи кодирующей последовательности или некодирующей последовательности. Обратный праймер разработан в дополнение к 3'-концу кодирующей цепи. Следовательно, он отжигает фланкирующий 3'-конец кодирующей цепи и позволяет Taq-полимеразе синтезировать антисмысловую цепь или матричную цепь. Поскольку его ориентация обратная, этот праймер помечен как обратный праймер..

Как обратные, так и прямые праймеры важны для производства миллионов или миллиардов копий определенных областей ДНК, которые нацелены или заинтересованы.

Каковы сходства между прямым и обратным праймером?

• Прямой и обратный праймеры состоят из олигонуклеотидов.
• Прямой и обратный праймеры имеют короткую нуклеотидную последовательность, комплементарную фланкирующим концам двойных цепей ДНК..
• Прямой и обратный праймеры обычно состоят из 20 нуклеотидов.
• Как прямой, так и обратный праймеры используются в полимеразных цепных реакциях..
• Прямой и обратный праймеры синтезируются коммерчески.
• Прямой и обратный праймеры являются стабильными при температуре и обычно имеют одинаковую Tm..
• Прямой и обратный праймеры отжигают с целевыми последовательностями ДНК..
• Прямой и обратный праймеры сконструированы в соответствии с реакциями ПЦР..
• Прямой и обратный праймеры служат отправной точкой для амплификации ДНК..
• Как обратные, так и прямые праймеры важны для производства миллионов копий определенных областей целевых или заинтересованных последовательностей ДНК..

В чем разница между прямым и обратным праймером??

Форвард Праймер против Обратного Праймера
Прямой праймер - это короткая последовательность ДНК, которая гибридизуется с 3'-концом некодирующей или матричной цепи гена и служит отправной точкой для синтеза кодирующей последовательности..	Обратный праймер - это короткая последовательность ДНК, которая гибридизуется с 3'-концом кодирующей или нетембранной цепи и служит отправной точкой для синтеза некодирующей последовательности..
Полоса отжига
Прямой отжиг праймера с шаблоном.	Обратный отжиг праймера с нетабличной прядью.
Результирующая новая последовательность
Прямой праймер облегчает синтез кодирующей последовательности.	Обратный праймер облегчает синтез некодирующей последовательности.

Резюме - Вперед против обратного праймера

Существует два типа праймеров, участвующих в методике ПЦР. Это прямой и обратный праймеры. На основании удлинения праймера в синтезе новой цепи ДНК эти праймеры помечены или названы. Taq-полимераза синтезирует новую ДНК в ориентации от 5 'до 3'. Следовательно, праймеры сконструированы как дополнительные к 3'-концам двойных нитей. Прямой праймер, который удлиняется в направлении от 5 'до 3', гибридизуется с 3 'концом антисмыслового или матричного или некодирующей последовательности. Он служит отправной точкой для синтеза кодирующей последовательности. Обратный праймер, который удлиняется в направлении от 5 'до 3', гибридизуется с 3'-концом кодирования, или нетекстломером, или смысловой цепью. Он служит отправной точкой для синтеза некодирующей последовательности. В этом разница между прямым и обратным праймером.

Ссылка:

1. «Праймер (Молекулярная биология)». Википедия, Фонд Викимедиа, 20 февраля 2018 г. Доступно здесь 
2. «Полимеразная цепная реакция (ПЦР)». Ханская академия. Доступна здесь 

Изображение предоставлено:

1.'Primers RevComp Melted2'By Ричард Уилер (Zephyris) - собственная работа, (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia