Разница между гель-электрофорезом и SDS Page

Ключевая разница - гель-электрофорез против SDS Page
 

Гель-электрофорез - это метод, который разделяет макромолекулы в электрическом поле. В молекулярной биологии распространен метод отделения ДНК, РНК и белков от смесей в соответствии с их молекулярными размерами. SDS Page - это тип гель-электрофореза, который используется для отделения белков от белковой смеси в зависимости от их размеров.. Гель-электрофорез - это термин, используемый для обозначения обычной методики, применяемой для разделения ДНК, РНК и белка. пока SDS Page является одним из видов гель-электрофореза. Это ключевое различие между гель-электрофорезом и SDS..

СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое гель-электрофорез
3. Что такое SDS Page
4. Сравнение бок о бок - гель-электрофорез против SDS Page
5. Резюме

Что такое гель-электрофорез?

Гель-электрофорез является распространенным методом, используемым в лабораториях для отделения заряженных молекул, таких как ДНК, РНК, белки и т. Д., От их смесей. Гель используется в гель-электрофорезе. Он действует как молекулярное сито. Существует два типа гелей, используемых в гель-электрофорезе, а именно агароза и полиакриламид. Выбор геля и гелевого препарата являются важными факторами, которые следует учитывать при гель-электрофорезе, поскольку необходимо тщательно манипулировать размером пор геля для хорошего разделения молекул с помощью гель-электрофореза. Гель-электрофорез имеет электрическое поле, соединенное с двумя концами геля. Один конец геля показывает положительный заряд, в то время как другой конец отрицательно заряжен.

ДНК и РНК являются отрицательно заряженными молекулами. Как только они загружены в гель с отрицательного конца геля и приложены к электрическому полю, они мигрируют через поры геля в направлении положительно заряженного конца геля. Скорость миграции зависит от заряда и размера молекулы. Меньшие молекулы легко мигрируют через поры геля, чем более крупные молекулы. Следовательно, более мелкие молекулы проходят большое расстояние через гель, а более крупные молекулы проходят небольшое расстояние. Для наблюдения за перемещением молекул на геле используются специальные типы красителей. Электрическое поле прикладывается в течение определенного периода времени и останавливается, чтобы предотвратить потерю молекул и удержать молекулы в их перемещенных положениях. В геле можно наблюдать разные полосы. Эти полосы представляют молекулы разных размеров. Следовательно, гель-электрофорез полезен для дифференциации молекул в зависимости от их размеров..

Гель-электрофорез включен в различные методы в качестве препаративного метода в молекулярной биологии, такие как ПЦР, RFLP, клонирование, секвенирование ДНК, саузерн-блоттинг, картирование генома и т. Д..

Рисунок 01: электрофорез в агарозном геле

Что такое SDS Page?

Электрофорез в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия (SDS Page) - это тип гель-электрофореза, используемый для разделения белков. Когда гель-электрофорез используется для разделения белков, необходимы специальные процедуры, поскольку белки не заряжены отрицательно, как ДНК и РНК, и не мигрируют к положительному концу или отрицательному концу. Следовательно, белки денатурируют и покрывают отрицательным зарядом перед гель-электрофорезом. Это делается с использованием моющего средства под названием додецилсульфат натрия (SDS). Гель-электрофорез, который использует SDS и полиакриламидный гель для поддерживающей среды, известен как SDS. Этот метод широко используется в биохимии, генетике, криминалистике и молекулярной биологии..

Во время SDS Page белки смешиваются с SDS. SDS разворачивает белки в линейную форму и покрывает их отрицательным зарядом, пропорциональным их молекулярной массе. Из-за отрицательного заряда молекулы белка мигрируют к концу положительного заряда геля и разделяются в соответствии с их молекулярными массами. На SDS Page полиакриламид используется в качестве твердой подложки для геля. Фактическое разделение белков в основном зависит от свойств геля. Следовательно, приготовление полиакриламидного геля должно быть тщательно сделано, и должны использоваться правильные концентрации полиакриламида. Полиакриламидные гели показывают высокое разрешение, чем агарозные гели. Следовательно, SDS Page считается техникой разделения белков с высоким разрешением.

SDS Page представляет собой тип денатурирующего гель-электрофореза. У этого есть главное ограничение в анализе белка. Поскольку SDS денатурирует белки перед разделением, это не позволяет определять ферментативную активность, белковые связывающие взаимодействия, кофакторы белка и т. Д..

Рисунок 02: Страница SDS

В чем разница между гель-электрофорезом и SDS Page?

Гель-электрофорез против SDS Page

Гель-электрофорез - это метод разделения макромолекул с помощью электрического поля.. SDS Page - это метод гель-электрофореза высокого разрешения, используемый для разделения белков на основе их массы..
Гель Ран
Это может быть выполнено в горизонтальной или вертикальной манере. SDS Page всегда работает вертикально.
Основа для разделения
Разделение происходит в зависимости от заряда и размера. Разделение белка происходит в зависимости от массы и заряда.
  разрешение
Электрофорез в агарозном геле имеет низкое разрешение, а электрофорез в полиакриламидном геле имеет более высокое разрешение SDS Page имеет лучшее разрешение.
денатурация
Гель-электрофорез включает как денатурирующие, так и неденатурирующие методы.. SDS Page денатурирует белки перед разделением.

Резюме - Гель-электрофорез против SDS Page

Гель-электрофорез является распространенным методом, используемым для разделения и анализа ДНК, РНК и белков в зависимости от их размера и заряда. Существует два основных типа гель-электрофореза, а именно электрофорез в агарозном геле и электрофорез в полиакриламидном геле. Агарозные гели используются главным образом для разделения нуклеиновых кислот; когда требуется более высокое разрешение, используются полиакриламидные гели. SDS Page - это тип гель-электрофореза, обычно используемый для разделения сложных смесей белков. Это рассматривается как метод разделения белков с высоким разрешением. В этом разница между гель-электрофорезом и SDS..

Ссылки:
1. Новаковски, Эндрю Б., Уильям Дж. Вобиг и Дэвид Х. Петеринг. «Native SDS-PAGE: электрофоретическое разделение белков с высоким разрешением с сохранением нативных свойств, включая ионы связанных металлов. www.ncbi.nlm.nih.gov. N.p., май 2014. Веб. 7 апреля 2017
2. Stellwagen, Nancy C. «Электрофорез ДНК в агарозных гелях, полиакриламидных гелях и в свободном растворе». Электрофорез. Национальная медицинская библиотека США, июнь 2009 г. Интернет. 07 апреля 2017

Изображение предоставлено:
1. «Gelelektrophoreseapparatur» (CC BY-SA 3.0) с помощью Commons Wikimedia
2. «Электрофорез в ДНК-агарозном геле» Школой природных ресурсов Энн Арбор - ДНК-лаборатория (CC BY 2.0) через Commons Wikimedia