Различие между геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК

ключевое отличие между геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК является то, что выделение геномной ДНК направлено на выделение геномной ДНК, а выделение плазмидной ДНК направлено на выделение плазмидной ДНК бактерий.

Выделение ДНК - это химический процесс, который используется для выделения ДНК из разных видов или из разных образцов. Выделение ДНК важно в следующих технологиях молекулярной биологии, таких как гель-электрофорез, полимеразная цепная реакция и методы секвенирования ДНК. Поэтому выделение ДНК является важным химическим процессом в молекулярно-биологических исследованиях. Исходя из цели исследования, иногда необходимо выделить геномную ДНК. Кроме того, некоторые исследования направлены на выделение плазмидной ДНК из бактерий. Выделение геномной ДНК - это процесс выделения геномной ДНК из прокариотического или эукариотического образца. Стадии выделения различаются в зависимости от типа клетки, в которой выделяется ДНК. Выделение плазмидной ДНК представляет собой процесс выделения плазмидной ДНК из бактериальной клетки. По сравнению с выделением геномной ДНК, общий процесс сложен в выделении плазмидной ДНК..

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое выделение геномной ДНК
3. Что такое выделение плазмидной ДНК
4. Сходство между геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК
5. Сравнение бок о бок - геномная ДНК против выделения плазмидной ДНК в табличной форме
6. Резюме

Что такое выделение геномной ДНК?

Выделение геномной ДНК - это процесс выделения цельной геномной ДНК организма. Этот конкретный процесс включает в себя три основных события. Это клеточный лизис или ядерный лизис, расщепление белка или протеолиз и осаждение геномной ДНК. Стадия лизиса может отличаться в зависимости от типа клеток. У прокариот, поскольку существует клеточная стенка пептидогликана, первым шагом должно быть разрушение клеточной стенки. С другой стороны, у эукариот стадия лизиса включает разрушение плазматической мембраны и ядерной мембраны, чтобы вывести ДНК наружу. В отличие от этого, специальные шаги необходимы для лизирования клеточных стенок растений и грибов..

Рисунок 01: Выделение геномной ДНК

Следовательно, как только этап лизиса завершится, в конечном итоге ДНК попадет в супернатант. Одновременно в растворе также происходит деградация белка из-за добавления протеиназы К. Следующим шагом является отделение геномной ДНК и деградированных белков друг от друга. Следовательно, деградированные белки отделяются осаждением, позволяя геномной ДНК оставаться в супернатанте. После осаждения белков геномная ДНК может быть осаждена и ресуспендирована в подходящем буфере, пока это не требуется для эксперимента..

Геномная ДНК, которая является линейной ДНК, содержит всю генетическую информацию организма. Другими словами, геном является материалом наследственности живого организма, который отвечает за все структурные и функциональные действия клетки. Он состоит из кодирующих и некодирующих последовательностей ДНК. При выделении геномной ДНК в нее входит весь геном организма.

Что такое выделение плазмидной ДНК?

Выделение плазмидной ДНК представляет собой особый и более сложный процесс выделения ДНК. Плазмиды представляют собой внехромосомную ДНК, присутствующую в большинстве бактериальных клеток. Они представляют собой дремлющую кольцевую ДНК, которая помогает бактериям выживать в суровых условиях окружающей среды. Плазмидная ДНК состоит из специальных устойчивых генов, которые обеспечивают дополнительные преимущества для бактерий, такие как устойчивость к антибиотикам, свойства вирулентности и токсические свойства..

Рисунок 02: выделение плазмидной ДНК

Выделение плазмидной ДНК также включает три основных процесса; лизис клеток, протеинолиз и осаждение ДНК. Хотя биохимический механизм выделения похож на механизм выделения геномной ДНК, этот процесс более сложный, чем он. Процесс лизиса клеток является наиболее важным процессом в этой процедуре. Самое главное, что геномная ДНК и плазмидная ДНК не должны смешиваться друг с другом. Следовательно, гораздо более мягкий процесс лизиса включается в процедуру выделения плазмидной ДНК. Следовательно, в большинстве процедур выделения плазмидной ДНК используют детергент; додецилсульфат натрия для лизиса клеток.

Каковы сходства между геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК?

• Выделение геномной ДНК и плазмидной ДНК направлено на извлечение ДНК организма.
• Кроме того, оба следуют одному и тому же общему процессу, который включает лизис клеток, распад белка и осаждение ДНК..
• Кроме того, полученные ДНК обоих процессов важны для последующих процессов..
• Кроме того, оба процесса выделения включают стадии очистки и хранения ДНК при определенных условиях хранения..
• Кроме того, протеиназа К используется в обоих методах для расщепления белков..

В чем разница между геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК?

Выделение геномной ДНК направлено на извлечение всей геномной ДНК целевого организма, в то время как выделение плазмидной ДНК направлено на выделение только плазмидной ДНК из определенных видов бактерий. Следовательно, в этом заключается ключевое различие между геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК. Кроме того, еще одно различие между выделением геномной ДНК и плазмидной ДНК заключается в процедуре. Выделение геномной ДНК является менее сложной процедурой по сравнению с выделением плазмидной ДНК. Следовательно, при выделении плазмидной ДНК необходимо принимать меры предосторожности, чтобы предотвратить смешивание геномной и плазмидной ДНК друг с другом..

Приведенная ниже информация предоставляет дополнительную информацию о разнице между геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК..

Резюме - Геномная ДНК против выделения плазмидной ДНК

Выделение ДНК является важным процессом в методах молекулярной биологии. Существует два типа ДНК, а именно геномная ДНК и плазмидная ДНК (внехромосомная ДНК). Исходя из требования, некоторые процедуры проводят для выделения геномной ДНК, в то время как некоторые процедуры направлены на выделение только плазмидной ДНК из бактерий. Следовательно, шаги, вовлеченные в оба процесса, немного отличаются друг от друга. Тем не менее, общий процесс одинаков в обеих изоляциях. Изолированная ДНК обоих процессов имеет огромное применение в последующих процессах, таких как клонирование, гель-электрофорез и полимеразные цепные реакции. В конце протокола выделения геномной ДНК вся геномная ДНК организма может быть выделена в качестве конечного продукта, в то время как в конце протокола выделения плазмидной ДНК плазмидная ДНК соответствующей бактерии может быть выделена в качестве конечного продукта. Следовательно, в этом заключается разница между геномной ДНК и выделением плазмидной ДНК..

Ссылка:

1. «Извлечение ДНК из бактерий». Извлечение ДНК из бактерий. Доступна здесь 

Изображение предоставлено:

1. «Извлечение ДНК» Джу Натом - собственная работа (CC BY-SA 4.0) через Commons Wikimedia 
2. «Plasmid miniprep» By Retama - собственная работа, (CC BY-SA 4.0) через Commons Wikimedia