Разница между генотипированием и секвенированием

Ключевая разница - генотипирование против секвенирования
 

Генотипирование и секвенирование - это две техники, выполняемые для получения информации о нуклеиновых кислотах, главным образом ДНК организма. Основное различие между генотипированием и секвенированием заключается в том, что генотипирование - это процесс определения генетического варианта, которым обладает индивид, с использованием маркеров, а секвенирование - определение правильного порядка нуклеотидной последовательности в данном фрагменте ДНК..

СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое генотипирование
3. Что такое секвенирование
4. Сравнение бок о бок - генотипирование против секвенирования
5. Резюме

Что такое генотипирование?

Генотипирование - это определение генетического состава человека с использованием последовательности ДНК и маркеров, а также сравнение и идентификация его наследования. Генотипирование важно в эволюционной биологии, биологии населения, таксономии, экологии и генетике организмов. Это может быть выполнено различными методами, включая секвенирование ДНК, полимеразную цепную реакцию, полиморфизм длины рестрикционных фрагментов (RFLP), случайное усиленное полиморфное детектирование, полиморфизм длин амплифицированных фрагментов (AFLP), микрочипы ДНК и т. Д..

Генотипирование включает секвенирование отдельных небольших фрагментов последовательностей ДНК и обнаружение родства генетической композиции с другими индивидуумами с использованием генетических маркеров. Он определяет единичные нуклеотидные полиморфизмы (SNP) среди индивидуумов или специфических аллелей. Генотипирование применимо к широкому кругу организмов, включая людей. Он также применим к микроорганизмам, таким как вирусы, грибки и т. Д., И может использоваться для определения их генетических вариантов с помощью эталонных профилей. В молекулярной эпидемиологии и судебной микробиологии контроль над патогенами, особенно микроорганизмами, осуществляется с помощью информации, полученной из генотипирования. Генотипирование очень важно в родословном анализе. Люди генотипируются для подтверждения материнства и отцовства. Генотип выявит доминантные и рецессивные аллели генов, которые определяют конкретные признаки.

Рисунок_1: Генотипирование RFLP

Что такое секвенирование?

Секвенирование - это процесс определения правильного порядка нуклеотида в данном фрагменте ДНК или РНК. Практически вся информация, необходимая для роста и развития организма, закодирована в его геноме. Наличие методов получения и разделения фрагментов нуклеиновых кислот длиной в несколько сотен нуклеотидов привело к разработке процедур определения точной нуклеотидной последовательности данного фрагмента ДНК или РНК. Различные типы методов секвенирования доступны сегодня. Эти методы секвенирования вместе с технологиями для создания библиотек генома, представляющих весь геном организма, облегчают секвенирование всего генома этого организма, делая глубокий анализ структур генов, функций генов, местоположений генов, выражений генов, картирование генов, регуляторные области генов.

Общие геномы многих вирусов, нескольких бактерий, архебактерий, дрожжей и некоторых других организмов были секвенированы и картированы. Проект «Геном человека» позволил упорядочить и нанести на карту весь геном человека и опубликовать его первый проект в 2003 году. Это важный этап в развитии биологии. Последовательности генома человека в настоящее время используются в медицинском секторе для выявления генетических причин редких заболеваний, выявления риска заболеваний у новорожденных, выявления генетических особенностей различных видов рака, разработки новых терапевтических средств, разработки новых диагностических инструментов и т. Д..

В растительном мире секвенированы геном риса и арабидопсис. Знание этих последовательностей, несомненно, революционизирует наше понимание того, как функционируют клетки и организмы..

Рисунок 2: Авторадиограф секвенирования Сэнгера

В чем разница между генотипированием и секвенированием?

Генотипирование против секвенирования
Генотипирование - это процесс определения генетического состава индивида и проверки группы или таксономии этого организма..	Секвенирование - это процесс определения точного порядка нуклеотидов данного фрагмента ДНК или РНК..
методы
RFLP, секвенирование генов, ПЦР, ДНК-микрочипы, AFLP и т. Д..	Секвенирование Сэнгера, секвенирование Гилберта, пиросеквенирование, секвенирование следующего поколения, секвенирование дробовика и т. Д..
Основные проблемы
Это больше касается того, дают ли различия генотипа фактические различия фенотипа..	Это больше касается порядка нуклеотидов и его различий и изменений с другими организмами.

Резюме - Генотипирование против секвенирования

Генотипирование и секвенирование полезны для изучения генетической информации организмов. Генотипирование - это процесс определения вариаций генотипа среди людей и определения их категорий. Секвенирование - это процесс определения правильного порядка нуклеотидов в интересующем фрагменте или области ДНК. Оба метода предоставляют важную информацию о генах и геномах.

Ссылка:
1. «Методы генотипирования». Методы молекулярной биологии (Клифтон, Нью-Джерси). Национальная медицинская библиотека США, н.д. Web. 20 февраля 2017.
2. Эйки, Дж. М., Д. Сосноски, Э. Парра, С. Диос, К. Хейстер, Б. Су, С. Бонилла, Л. Джин и М. Д. Шрайвер. «Анализ кривых плавления SNP (McSNP:): недорогой и недорогой подход к генотипированию SNP». BioTechniques 30.2 (2001): 358-67. Web.

Изображение предоставлено:
1. «Генотипирование RFLP» (неизвестно) - Национальные институты здравоохранения (общественное достояние) через Commons Wikimedia
2. «Радиоактивный флуоресцентный» Абизар из английской Википедии (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia