Разница между векторами вставки и замены

ключевое отличие между векторами вставки и замены есть то, что вектор вставки обладает способностью вставлять чужеродную ДНК умеренной длины, тогда как вектор замены способен приспосабливаться к чужеродной ДНК большей длины.

Фаговые векторы - это бактериофаги, используемые для клонирования. Есть два типа фаговых векторов; они являются вектором вставки и вектором замены. Также все фаговые векторы состоят из несущественных генов. Тем не менее, эти гены должны быть удалены из фагов, чтобы облегчить новые чужеродные вставки ДНК.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое векторы вставки
3. Что такое векторы замены
4. Сходство между векторами вставки и замены
5. Сравнение бок о бок - вставка и замена векторов в табличной форме
6. Резюме

Что такое вектор вставки?

Прежде всего, вектор вставки является самой простой формой лямбда-клонирующих векторов. Фактически, это тип фагового вектора, который имеет уникальный сайт рестрикции, введенный в геном вектора в положении необязательной ДНК. Кроме того, ДНК фага остается без удаления. Это не удаление ДНК фага ограничивает размер вставок (чужеродной ДНК), которые должны быть клонированы в векторе. Более того, эти векторы полезны при клонировании и экспрессии кДНК. GT10, GT11 и Zap являются примерами этого вектора.

Рисунок 01: Лямбда-фаг

Вектор вставки состоит из одного сайта распознавания. Основной функцией этого вектора является разработка библиотек кДНК, полученных из последовательностей мРНК эукариот. Более того, он может приспосабливаться только к длинам чужеродной ДНК в диапазоне между 5-11 кб. Кроме того, он обладает уникальным сайтом расщепления для вставки чужеродной ДНК.

Что такое векторы замены?

Вектор замены или вектор замещения представляет собой тип фагового вектора, полученный в результате удаления средней области «фрагмента наполнителя» ДНК фага. Требуемая вставка чужеродной ДНК заменяет ДНК фага.

Рисунок 02: Вектор замены

Заменяющие векторы важны при создании геномных библиотек, таких как EMBL4 и Charon40. Эти векторы могут вместить большую длину чужеродной ДНК в диапазоне длин между 08-24kb. Область наполнителя также состоит из гена, который делает фаговый вектор нежизнеспособным внутри бактериального хозяина.

Каковы сходства между векторами вставки и замены?

• Векторы вставки и замены являются фаговыми векторами.
• Оба вектора вмещают чужеродные вставки ДНК.
• Они оба полезны в создании библиотек ДНК.

В чем разница между векторами вставки и замены?

Вставка против замены векторов
Вектор вставки представляет собой тип фагового вектора, который имеет сайт рестрикции, введенный в геном фага в сайте необязательной ДНК..	Вектор замещения представляет собой тип фагового вектора, созданного путем удаления средней области «фрагмента наполнителя» ДНК фага
Размер фрагментов вставки
Длина 05-11 кб	Длина 08-24 кб
Фрагмент наполнителя
Нет фрагмента наполнителя	Фрагмент заполнителя заменяется чужой вставкой
функция
Важно создавать библиотеки кДНК	Важное значение при создании библиотек генома
Примеры
GT10, GT11 и Zap являются примерами	EMBL4 и Charon40 являются примерами
Сайт расщепления
Уникальный сайт расщепления присутствует	Сайт расщепления содержит гены, которые не являются необходимыми для литического цикла

Резюме - вставка и замена векторов

Векторы вставки и замены представляют собой два типа векторов фага. Оба вектора имеют сайты рестрикции, которые облегчают размещение новых чужеродных вставок ДНК. Векторы вставки важны при создании библиотек кДНК, а векторы замещения важны при создании библиотек генома. Кроме того, векторы вставки вмещают вставки ДНК умеренной длины. Но замещающие векторы могут приспосабливать более длинные длины чужеродных вставок ДНК. В целом, это ключевое различие между векторами вставки и замены.

Ссылка:

1. Hasty, P, et al. «Эффективность внедрения по сравнению с вектором замены, изменяющимся в различных хромосомных локусах». Молекулярная и клеточная биология, Национальная медицинская библиотека США, декабрь 1994 г., доступно здесь.
2. «Векторы лямбда-вставок». Биология 335 Конспект лекций - лямбда-векторы, доступные здесь.
3. «Вектор замены». Вектор замены - Терминология молекулярной биологии для вектора замены - GenScript, доступен здесь.

Изображение предоставлено:

1. «Лямбда-фаг» Лизанна Кох - собственная работа с ChemBioDraw (Public Domain) через Commons Wikimedia