Разница между переводом Ника и расширением учебника для начинающих

Ключевая разница - перевод Ника против расширения праймера
 

Перевод Ника и расширение праймера - два важных метода, выполняемых в молекулярной биологии. Основное различие между переводом никнейма и расширением праймера заключается в том В процессе трансляции никнейта получают меченые зонды для других методов гибридизации. пока метод удлинения праймера идентифицирует специфическую последовательность РНК из смеси и выявляет информацию об экспрессии мРНК. Оба метода имеют большое значение и обычно выполняются в лабораториях молекулярных исследований..

СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое перевод Nick
3. Что такое расширение праймера
4. Сравнение бок о бок - перевод Ника и расширение праймера
5. Резюме

Что такое перевод Nick?

Перевод Ника - важный метод, используемый для подготовки меченых зондов для различных молекулярно-биологических методов, таких как блоттинг., на месте гибридизация, флуоресцентная на месте гибридизация и т. д. Это в пробирке метод маркировки ДНК. ДНК-зонды используются для идентификации специфических последовательностей ДНК или РНК. С помощью меченого зонда конкретные фрагменты могут быть помечены или визуализированы из сложной смеси нуклеиновой кислоты. Поэтому меченые зонды готовятся с использованием различных методов, которые будут использоваться для различных методов. Nick-трансляция является одним из таких методов, который производит меченые зонды с помощью ферментов ДНКазы 1 и ДНК-полимеразы 1..

Процесс трансляции никнейма начинается с активности фермента ДНКазы 1. ДНКаза 1 вводит ники в фосфатный остов двухцепочечной ДНК, разрывая фосфодиэфирные связи между нуклеотидами. Как только ник будет создан, будет получена свободная 3'-ОН группа нуклеотида, и на нее будет действовать фермент ДНК-полимераза 1. От 5 'до 3' экзонуклеазной активности ДНК-полимеразы 1 удаляет нуклеотиды из ника в направлении 3 'направления цепи ДНК. Одновременно работает полимеразная активность фермента ДНК-полимеразы 1 и добавляет нуклеотиды для замены удаленных нуклеотидов. Если нуклеотиды были помечены, замена будет осуществляться помеченными нуклеотидами, и это пометит ДНК для идентификации. Эта вновь синтезированная меченая ДНК может быть использована в качестве зондов в различных реакциях гибридизации в молекулярной биологии..

Рисунок 01: Процесс перевода Ника

Что такое расширение праймера?

Удлинение праймера - это метод, который используется для поиска специфической последовательности РНК из смеси РНК и определения местоположения 5'-конца транскрипта мРНК. Он также используется для изучения структуры РНК и экспрессии. Метод удлинения праймеров осуществляется с помощью меченых праймеров или с мечеными нуклеотидами. Если используют меченые праймеры, это исключает необходимость маркировки нуклеотидов, которые используются для синтеза кДНК. Есть несколько шагов в этой технике. Начинается с выделения РНК из образца. Затем к смеси добавляют меченый олигонуклеотидный праймер вместе с необходимыми ингредиентами для синтеза кДНК определенной последовательности РНК. Отжиг праймеров с комплементарной последовательностью из смеси. Используя отожженную последовательность праймера в качестве матрицы, фермент обратная транскриптаза синтезирует комплементарную ДНК (кДНК) последовательности РНК. Отжиг праймеров и обратная транскрипция происходят только тогда, когда в образце присутствует специфическая последовательность РНК. Наконец, когда проводят электрофорез в денатурирующем геле, можно определить размер последовательности РНК. Также легко найти +1 основание последовательности мРНК (сайт инициации транскрипции) методом удлинения праймера. Количество мРНК, присутствующей в образце, может быть определено количественно этим методом, если используется избыток праймера..

Рисунок 02: Расширение праймера

В чем разница между переводом Ника и расширением учебника для начинающих?

Перевод Ника против Расширения Учебника для начинающих
Перевод Ника - это процесс, который создает меченые ДНК-зонды для различных реакций гибридизации..	Удлинение праймера - это метод, используемый для поиска специфической РНК или для изучения экспрессии генов..
Используемые ферменты
Используются ферменты ДНКазы 1 и ДНК-полимеразы.	Фермент обратной транскриптазы используется.
значение
Перевод Ника облегчает маркировку определенной последовательности ДНК.	Удлинение праймера позволяет определять конкретный размер последовательности мРНК и количество, присутствующее в образце.

Резюме - перевод Ника против Расширения Учебника

Перевод Ника - это метод, используемый для синтеза меченых зондов, основанный на активности ДНКазы 1 и E coli ДНК-полимераза 1 ферменты. Это в пробирке метод, применяемый в лабораториях до различных методов гибридизации. Во время трансляции ник 5'-3'-экзонуклеазная активность ДНК-полимеразы 1 удаляет нуклеотиды перед ником, а полимеразная активность ДНК-полимеразы 1 заменяет удаленные нуклеотиды мечеными нуклеотидами за ником. Расширение праймера - это метод, который используется для обнаружения конкретного транскрипта РНК из смеси и количественного определения размера и количества представляющей интерес РНК. В этом разница между переводом никнейма и расширением праймера..

Ссылки
1. Рид, Алекс. «Ник Перевод». Springer. Н.п., н.д. Web. 18 апреля 2017
2. «Расширение праймера». Национальная диагностика. Н.п., н.д. Web. 19 апреля 2017
3. Куо, М. Т. и В. Планкетт. «Ник-трансляция метафазных хромосом: маркировка in vitro нуклеазо-гиперчувствительных областей в хромосомах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. Национальная медицинская библиотека США, февраль 1985 года. Интернет. 19 апреля 2017
4. Раймонд и соавт. «Простой количественный ПЦР-анализ с удлинением праймера для прямого мониторинга микроРНК и короткоживущих РНК». РНК. Copyright 2005 от RNA Society, ноябрь 2005. Веб. 19 апреля 2017

Изображение предоставлено:
1. «Анализ расширения праймера» Jjnmmnjj - собственная работа (CC BY-SA 3.0) с помощью Commons Wikimedia