Разница между Rho зависимым и Rho независимым окончанием

ключевое отличие между Rho-зависимым и Rho-независимым окончанием является то, что в Rho-зависимое завершение, Rho-фактор связывается с транскриптом и завершает транскрипцию, разрывая водородные связи между шаблоном и транскриптом, в то время как Rho-независимое завершение завершает транскрипцию, создавая структуру петли шпильки и затем U-обогащенную область в транскрипте.

Транскрипция является одним из двух этапов генной экспрессии. Это процесс, который производит последовательность мРНК из генетической информации, скрытой в последовательности ДНК гена. Транскрипция происходит в три этапа: инициация, удлинение и окончание. Фермент РНК-полимераза связывается с промоторной последовательностью гена и начинает катализировать синтез цепи РНК. Пока последовательность терминатора не найдена, РНК-полимераза добавляет нуклеотиды и строит цепь РНК. У прокариот прекращение происходит посредством двух основных стратегий завершения: зависимое от Rho завершение и независимое от Rho завершение. Rho-фактор - это белок, обладающий геликазной активностью..

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое Rho-зависимое завершение
3. Что такое независимое завершение?
4. Сходства между Rho-зависимым и Rho-независимым терминациями
5. Сравнение бок о бок - Rho Dependent и Rho Независимое завершение в табличной форме
6. Резюме

Что такое Rho-зависимое завершение?

Rho-зависимая терминация является одним из двух типов стратегии терминации транскрипции, встречающейся у прокариот. Rho-фактор - это белок, обладающий геликазной активностью..

Рисунок 01: Зависит от Rho

Rho белок связывается с РНК-транскриптом и движется вдоль РНК-полимеразы в направлении 5'-3 ', стимулируя диссоциацию водородных связей между ДНК-матрицей и РНК-транскриптом. Когда Rho-фактор достигает пузыря транскрипции, он разделяет гибрид ДНК / РНК и высвобождает транскрипт из пузыря транскрипции. Когда это происходит, он прекращает транскрипцию.

Что такое независимое завершение??

Rho-независимое завершение является второй стратегией, которая прекращает прокариотическую транскрипцию. Обычно область терминатора имеет инвертированную повторяющуюся последовательность. Сразу после инвертированной повторяющейся последовательности появляется область, богатая аденином (AAAA). Когда РНК-полимераза движется вперед, она продуцирует последовательность мРНК. Поскольку эти две области являются комплементарными в области инвертированной повторяющейся последовательности, она образует структуру петли шпильки из-за водородной связи. Следующим регионом будет богатый регион U. Структура шпильки прекращает РНК-полимеразную активность.

Рисунок 02: Независимое завершение Rho

Более того, в U-богатых регионах наблюдается слабое взаимодействие между U-основами транскрипта и A-основами шаблона. Эти слабые связи аденин-урацил дестабилизируют матрицу ДНК и транскрипт РНК и разделяют друг друга. В конце транскрипт освобождается от сайта транскрипции.

Каковы сходства между Rho-зависимым и Rho-независимым терминациями??

• Rho-зависимая и Rho-независимая терминация - две основные стратегии терминации, обнаруживаемые у прокариот.
• Обе формы высвобождают транскрипт из матрицы ДНК для прекращения транскрипции.

В чем разница между Rho-зависимым и Rho-независимым терминациями??

Rho-зависимое окончание опосредуется Rho-белком, в то время как Rho-независимое окончание происходит через формирование структуры петли шпильки. Таким образом, это ключевое различие между зависимым от Rho и независимым от Rho окончанием. Кроме того, белок Rho использует энергию АТФ, в то время как независимое завершение Rho не включает белок Rho и не использует энергию АТФ. Следовательно, это также существенная разница между Rho-зависимым и Rho-независимым окончанием.

Приведенная ниже инфографика показывает больше сравнений, связанных с различием между Rho-зависимым и Rho-независимым окончанием.

Резюме - Rho Dependent против Rho Independent Termination

Rho-зависимая и Rho-независимая терминация являются двумя основными механизмами терминации транскрипции, встречающимися у прокариот. Белок Rho ответственен за терминацию транскрипции в зависимом от Rho терминации. Напротив, независимое от Rho завершение происходит посредством формирования структуры петли шпильки. Таким образом, это ключевое различие между Rho-зависимым и Rho-независимым окончанием.

Ссылка:

1. «Этапы транскрипции». Ханская академия, доступна здесь.
2. «Внутреннее прекращение». Википедия, Фонд Викимедиа, 8 февраля 2019 г., доступно здесь.

Изображение предоставлено:

1. «Rho-зависимый терминатор». Oalnafo1 - собственная работа (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia.
2. «Rho-независимый терминатор» Ppgardne из английской Википедии (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia