Разница между целевой и нецелевой протеомикой

Ключевое различие между целевой и нецелевой протеомикой заключается в том, что целевая протеомика направлена ​​на измерение содержания определенного белка, тогда как нецелевая протеомика не нацелена на конкретный белок.

Протеомика - это широкомасштабное исследование белков, их структуры и функций. Он изучает весь белковый комплемент в клетке, ткани или организме в определенных условиях. Существует два типа протеомики: целевая протеомика и нецелевая протеомика.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое целевая протеомика
3. Что такое нецелевая протеомика
4. Сходство между целевой и нецелевой протеомикой
5. Сравнение бок о бок - целевая и нецелевая протеомика в табличной форме
6. Резюме

Что такое целевая протеомика?

Как видно из названия, целевая протеомика нацеливается на специфический белок или пептид в сложной смеси белков для анализа. Затем он анализирует наличие и количество этого предварительно выбранного конкретного белка. Этот метод возможен только для одного образца или для нескольких образцов. Этот метод подходит даже для определенной группы белков. Это приводит к более точным, количественным и чувствительным данным. Кроме того, масс-спектрометрия в сочетании с целевой протеомикой дает более точные и надежные измерения. Этот метод использует тройной квадрупольный масс-спектрометр (QQQ) для своего анализа.

Рисунок 01: Протеомика

Целевая протеомика является подходящим методом, если вы хотите проверить, действительно ли сбита мишень с нокдауном или если вы хотите количественно определить определенный белок / пептид в сыворотке крови, церебральной жидкости или в лизате клеток и т. Д. Вы также можете использовать его, если хотите чтобы проверить, дифференцирован ли определенный белок по образцам или во время эксперимента.

Что такое нецелевая протеомика?

Нецелевая протеомика, как следует из названия, не нацеливается на специфический белок или пептид для его анализа.. Discovery протеомика другое название для нецелевой протеомики. Фактически, это более «глобальный» анализ. Как правило, выполнение нецеленаправленной протеомики - это ответ на вопрос «какой белок или белки находятся в этом образце или нескольких образцах?». Этот метод не чувствителен как целевая протеомика. Но он может идентифицировать и измерить многие белки, включая новые белки. Нецелевая протеомика может производить как количественные, так и качественные измерения.

Каковы сходства между целевой и нецелевой протеомикой?

• Как целевые, так и нецелевые протеомики измеряют белки в образцах.
• Они важны в анализе протеома.
• Эти методы используют масс-спектрометрию.

В чем разница между целевой и нецелевой протеомикой?

Во-первых, целевой протеомикой является определение наличия и количества определенного белка или пептида в сложной смеси белков. Напротив, нецелевая протеомика - это количественное и качественное исследование белков, присутствующих в образце или образцах, без нацеливания на конкретный белок. Целевая протеомика выполняется с предварительно отобранными или целевыми белками, тогда как нецелевая протеомика проводится для определения типов белков в этом образце. Более того, целевая протеомика более чувствительна, чем нецелевая протеомика.

Резюме - Targeted vs Untargeted Proteomics

Подводя итог, целевые и нецелевые протеомики являются двумя типами исследований белка. Как следует из их названия, целевая протеомика нацелена на конкретный белок, тогда как нецелевая протеомика не нацелена на конкретный белок. В этом разница между целевой и нецелевой протеомикой.

Ссылка:

1. «Целевая протеомика». UC Davis Proteomics Core, доступно здесь.
2. «Протеомика / Введение в протеомику». Теория музыки / Режимы - Wikibooks, Открытые книги для открытого мира, доступны здесь.

Изображение предоставлено:

1. «Протеомика» Xxl7441 на английском Wikibooks - перенесено из en.wikibooks в Commons (Public Domain) через Commons Wikimedia