Разница между VNTR и STR

Ключевая разница - VNTR против STR
 

Исследования ДНК имеют огромное значение для понимания и определения филогенетических отношений, диагностики генетических заболеваний и картирования геномов организма. Несколько методов, связанных с анализом ДНК, используются для идентификации конкретного гена или последовательности ДНК в пуле неизвестной ДНК. Они известны как генетические маркеры. Генетические маркеры используются в молекулярной биологии для выявления генетических различий между людьми и видами. Тандемный повтор с переменным числом (VNTR) и короткий тандемный повтор (STR) являются двумя типами генетических маркеров, которые показывают полиморфизм среди людей. Оба типа представляют собой некодирующие повторяющиеся ДНК, которые являются тандемными повторами. Они расположены по типу головы в хвосте в хромосомах. VNTR представляет собой участок генома, где короткая нуклеотидная последовательность повторяется несколько раз. STR является еще одним участком ДНК в геноме, который организован как повторяющиеся единицы, состоящие из двух-тринадцати нуклеотидов в сто раз. Ключевым отличием между VNTR и STR является количество нуклеотидов в повторяющейся последовательности. Повторяющиеся звенья VNTR состоят из 10-100 нуклеотидов, тогда как повторяющиеся звенья STR состоят из 2-13 нуклеотидов.. VNTR и STR широко используются в криминалистических исследованиях.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое ВНТР 
3. Что такое STR
4. Сходство между VNTR и STR
5. Сравнение бок о бок - VNTR против STR в табличной форме
6. Резюме

Что такое ВНТР?

Тандемный повтор представляет собой короткую последовательность ДНК, которая повторяется в направлении головы к хвосту в определенном хромосомном локусе. В тандемном повторе нет другой последовательности или нуклеотида. В геноме есть несколько типов тандемных повторов. VNTR представляет собой тип тандемного повтора среди них, который имеет повторяющиеся звенья, состоящие из 10-100 нуклеотидов. VNTR - это тип минисателлита. Эти тандемные повторы можно найти во многих хромосомах. Они вкраплены в геноме человека и расположены преимущественно в субтеломерных областях хромосом..

 VNTR показывают тандемный повтор полиморфизма среди людей. Длина VNTR в определенном месте хромосомы сильно варьируется среди людей из-за различий в количестве повторяющихся звеньев, организованных в этом разделе ДНК. Поэтому VNTR может использоваться в качестве мощного инструмента для идентификации людей, а анализ VNTR используется во многих областях, включая генетику, биологические исследования, криминалистику и ДНК-отпечатки пальцев. VNTR были первыми генетическими маркерами, использованными для количественной оценки приживления трансплантата костного мозга. VNTR были также первыми полиморфными маркерами, использованными при профилировании ДНК в криминалистике..

Рисунок 01: Вариация VNTR у шести человек

Анализ VNTR выполняется посредством полиморфизма длины рестрикционных фрагментов с последующей южной гибридизацией. Следовательно, ему нужен сравнительно большой образец ДНК. Интерпретация профиля VNTR также проблематична. Из-за этих ограничений использование VNTR в судебной генетике было ограничено, и его заменили анализом STR.

Что такое STR?

STR является высокоповторяющейся секцией ДНК, которая состоит из двух-тринадцати нуклеотидных повторяющихся звеньев, организованных тандемным образом. STR похож на VNTR. Но оно варьируется от VNTR от количества нуклеотидов в повторяющейся последовательности и количества повторов. STR - это тип микроспутника.

STR анализ участвует в измерении точного количества повторяющихся единиц. СПО сильно варьируют среди людей, аналогично ВНТ. Профили STR отличаются от человека к человеку. Поэтому STR анализ используется в молекулярной биологии для сравнения определенных локусов на ДНК из двух или более образцов. Следовательно, STR считаются мощными генетическими маркерами в молекулярной биологии. Это обеспечивает отличный инструмент для идентификации людей из-за их высокой степени полиморфизма и относительно короткой длины.

В настоящее время СПО являются наиболее часто используемым анализируемым инструментом генетического полиморфизма в судебной генетике. Большинство судебных дел связаны с полиморфным анализом STR. STR локусы распространены по всему геному. Есть тысячи STR, расположенных в хромосомах, которые могут быть использованы в криминалистическом анализе. Анализ STR не включает полиморфизм длины рестрикции, такой как анализ VNTR. STR анализ не разрезает ДНК рестриктазой. Специфические зонды используются для прикрепления желаемых областей к ДНК, и с помощью метода ПЦР определяются длины STR..

Рисунок 02: вариация STR между образцами

Каковы сходства между VNTR и STR?

• VNTR и STR являются некодирующей ДНК.
• Оба являются тандемными повторами.
• Оба показывают полиморфизм среди людей из-за разницы в длине среза ДНК.
• Оба используются в качестве мощных генетических маркеров в ДНК-отпечатках пальцев и в криминалистических исследованиях..

В чем разница между VNTR и STR?

ВНТР против СТР
VNTR представляет собой некодирующую повторяющуюся ДНК, которая имеет короткую нуклеотидную последовательность, повторяемую тандемным способом.	STR является высокоповторяющейся секцией ДНК, которая состоит из двух-тринадцати нуклеотидных повторяющихся звеньев, организованных тандемным способом..
Размер
VNTR больше, чем STR.	STR меньше, чем VNTR.
Количество нуклеотидов в повторяющейся последовательности
Повторяющаяся единица VNTR состоит из 10-100 нуклеотидов..	Повторяющаяся единица STR состоит из 2-13 нуклеотидов..

Резюме - ВНТР против СТР

VNTR и STR являются двумя мощными генетическими маркерами, используемыми в молекулярной биологии, особенно в области судебной генетики. VNTR - это тип минисателлита, а STR - это микроспутник. VNTR и STR являются некодирующей, очень повторяющейся ДНК. Они являются тандемными повторами. Общая структура VNTR и STR одинакова. Однако количество нуклеотидов в повторяющейся последовательности и длина различны. VNTR имеет повторяющиеся последовательности, состоящие из 10-100 нуклеотидов. STR имеет повторяющиеся последовательности, состоящие из 2-13 нуклеотидов. В этом разница между VNTR и STR.

Скачать PDF версию VNTR vs STR

Вы можете скачать PDF версию этой статьи и использовать ее в автономном режиме, как указано в примечаниях. Пожалуйста, загрузите PDF версию здесь Разница между VNTR и STR.

Ссылки:

1. «Наука судебной генетики». CRG - Совет по ответственной генетике. Н.п., н.д. Web. Доступна здесь. 10 июля 2017.
2. «STR анализ». Wikipedia. Фонд Викимедиа, 22 марта 2017 года. Интернет. Доступна здесь. 10 июля 2017.

Изображение предоставлено:

1. «D1S80Demo» Автор: PaleWhaleGail из английский Википедия (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia