Разница между клоном с помощью клонирования и дробовика

ключевое отличие между клоном секвенированием клона и секвенированием дробовика заключается в их методе поведения. Метод клонирования с помощью клонирования включает картирование хромосом и клонирование перед секвенированием, в то время как клон с помощью секвенирования с помощью дробовика исключает этапы картирования хромосом и клонирования во время секвенирования..

Клон с помощью секвенирования клонов и клон с помощью секвенирования с помощью дробовика являются двумя методами современного секвенирования генома. Секвенирование по клонам является более надежным методом секвенирования. Тем не менее, метод клонирования путем секвенирования дробовика быстрее и дешевле. Статья посвящена тонкой разнице между клоном путем секвенирования клона и дробовика.

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое клон с помощью клонирования 
3. Что такое клон с помощью дробовика
4. Сходство между клоном путем клонирования и дробовика
5. Сравнение бок о бок - секвенирование клон по клону и секвенирование по дробовику в табличной форме
6. Резюме

Что такое клон с помощью клонирования?

Клонирование путем клонирования является методом секвенирования генома. Требуется картирование каждой хромосомы до расщепления ДНК. После картирования ДНК должна быть разбита на фрагменты длиной 150 килобаз. Эти фрагменты затем готовы для секвенирования. Следующим шагом является вставка фрагментов ДНК в бактериальные искусственные хромосомы (BAC), а затем в бактериальные клетки. Поскольку фрагменты теперь находятся внутри бактериальных клеток, каждый раз, когда бактерии делятся, вставленные фрагменты ДНК также делятся и производят много идентичных копий. Затем ДНК отдельного бактериального клона фрагментируют на фрагменты длиной 500 пар оснований. Они меньше и перекрывают фрагменты. Затем происходит секвенирование с вставкой этих фрагментов в вектор с известной последовательностью ДНК. Начиная с известной последовательности вектора, секвенирование продолжается до неизвестной последовательности.

После завершения секвенирования необходимо определить области перекрывающихся последовательностей. После этого происходит объединение фрагментов с образованием более крупных фрагментов, первоначально представленных в BAC. Затем сборка более крупных фрагментов в хромосому происходит в соответствии с картой генома.

Рисунок 01: клон с помощью клонирования

Существенным преимуществом клона путем секвенирования клона является то, что предварительно подготовленная карта генома помогает надежной сборке более крупных фрагментов. Но недостатком этого метода секвенирования является то, что на создание геномных карт и создание клонов уходит много времени. Тем не менее, этот метод был предпочтительным во время «Проекта генома человека».

Что такое клон с помощью дробовика?

Секвенирование методом клонирования с помощью дробовика - это метод секвенирования, который случайным образом разбивает последовательности ДНК на множество небольших фрагментов и повторно собирает последовательность, наблюдая перекрывающиеся области. Более крупные геномы млекопитающих трудно клонировать в последовательности и собрать. Это связано с их структурной сложностью и размерами. Несмотря на то, что метод клонирования методом клонирования является надежным, для последовательности геномов сложных организмов требуется много времени. Таким образом, секвенирование методом клонирования с помощью дробовика стало надежным, более дешевым методом секвенирования, который можно выполнять быстрее. Следовательно, современные ученые полагаются на этот метод секвенирования для решения сложных геномов.

Рисунок 02: Клон с помощью дробовика

Во время клонирования методом секвенирования с помощью дробовика обычные этапы картирования генома и клонирования не выполняются. Первоначально весь геном фрагментирован на различные размеры от 20 килобаз до 300 килобаз. Далее происходит секвенирование. Затем, используя сложное компьютерное программное обеспечение, необходимо собрать фрагменты, взглянув на перекрывающиеся области..

Секвенирование методом клонирования с помощью дробовика помогает повысить точность существующих последовательностей генома. Основным преимуществом этого метода является то, что он намного быстрее и дешевле, чем метод клонирования методом клонирования. Однако этот процесс не предполагает использование генетической карты. Следовательно, ошибки во время сборки более вероятны. Таким образом, это является основным недостатком метода клонирования методом дробовика..

Каковы сходства между клоном с помощью клонирования и дробовика?

• И клон секвенированием клонов и секвенирование дробовика являются двумя методами секвенирования генома.
• Во время обоих методов секвенирования происходит сборка разбитых фрагментов путем определения перекрывающихся областей..
• Кроме того, расщепление ДНК на более мелкие фрагменты необходимо как для секвенирования клона, так и для дробовика..

В чем разница между клоном с помощью клонирования и дробовика?

Метод клонирования методом клонирования включает два основных этапа: картирование хромосом и клонирование. Напротив, последовательность клонов с помощью дробовика не следует этим двум шагам; он случайным образом разбивает последовательности ДНК на множество мелких фрагментов и повторно собирает последовательность, наблюдая перекрывающиеся области. Следовательно, это ключевое различие между клоном путем секвенирования клона и дробовика. Из-за этого факта, клонирование по последовательности клонов является дорогим и трудоемким процессом, в то время как клонирование методом дробовика происходит быстрее и дешевле..

Тем не менее, ошибки во время сборки менее вероятны во время клонирования с помощью последовательности клонов. Следовательно, он имеет высокую надежность. Тем не менее, клон путем дробовика является сравнительно менее надежным методом. Таким образом, это также существенная разница между клоном путем секвенирования клона и дробовика.

Приведенная ниже инфо-графика предоставляет дополнительную информацию о разнице между клоном по последовательности клонов и последовательности дробовика.

Резюме - клон по клонированию секвенирования против дробовика секвенирования

Подводя итог разнице между клоном секвенированием клона и секвенированием ружья, клон секвенированием клона и секвенированием ружья являются двумя методами секвенирования генома. Однако метод клонирования с помощью клонирования включает процессы картирования генома и клонирования, в то время как клонирование с помощью дробовика не делает этого. Таким образом, это ключевое различие между клоном с помощью последовательности клонов и последовательности дробовика. Поскольку картирование генома происходит во время клонирования путем секвенирования клонов, ошибки менее вероятны во время сборки последовательностей. Но клонирование с помощью дробовика намного быстрее и дешевле. Тем не менее, это сравнительно менее надежно. Секвенирование по клонам было предпочтительным методом секвенирования во время «Проекта генома человека». Но современный молекулярный биолог в большей степени полагается на клон при секвенировании.

Ссылка:

1. «Что такое клонирование по клону?» Факты, Команда по взаимодействию с общественностью в кампусе Wellcome Genome, 17 ноября 2014 г., доступно здесь.
2. «Что такое секвенсор?» Факты, Команда по взаимодействию с общественностью в кампусе Wellcome Genome, 17 ноября 2014 г., доступно здесь.

Изображение предоставлено:

1. «Шаги молекулярного клонирования» Alexpicardal97 - собственная работа, CC BY-SA 4.0) через Commons Wikimedia
2. «Дробовик секвенирования LG» Национальным научно-исследовательским институтом генома человека - Национальные институты здравоохранения. Национальный исследовательский институт генома человека. «Говорящий глоссарий генетических терминов». Получено 17 ноября 2016 г. (Public Domain) с помощью Commons Wikimedia