Вестерн-блоттинг - это метод, который позволяет обнаруживать и количественно определять конкретные белки из образца белка. Надежность методики зависит от выбора правильной мембраны для поглощения белков из геля. Существуют разные типы микропористых мембран. Мембраны из нитроцеллюлозы и PVDF - две такие мембраны, предпочитаемые исследователями из-за их особых свойств по сравнению с другими типами мембран. Выбор между нитроцеллюлозой или PVDF также является другой проблемой в вестерн-блоттинге. И нитроцеллюлоза, и PVDF обладают высокой способностью абсорбировать белок. Основное различие между нитроцеллюлозой и PVDF-мембраной заключается в том, что нитроцеллюлозные мембраны не способны удалять антитела и повторно использовать мембрану для повторной обработки антител, в то время как PVDF-мембраны обладают способностью к удалению и повторному использованию..
СОДЕРЖАНИЕ
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое нитроцеллюлоза
3. Что такое PVDF
4. Сравнение бок о бок - нитроцеллюлоза против PVDF
5. Резюме
Нитроцеллюлоза является полимером, полученным путем обработки целлюлозы азотной кислотой, и используется для изготовления микропористых мембран в молекулярной биологии, особенно для таких методов блоттинга, как южный, северный и западный блоттинг. Размеры пор нитроцеллюлозных мембран варьируются от 3 до 20 мкм. Нитроцеллюлозные микропористые мембраны облегчают обнаружение иммунохимической реакции, происходящей на поверхности мембраны. Поэтому нитроцеллюлозные мембраны часто используются для иммобилизации белков и обнаружения специфических белков при вестерн-блоттинге. Нитроцеллюлозные мембраны также могут иммобилизовать гликопротеины и нуклеиновые кислоты.
Нитроцеллюлозные мембраны являются предпочтительными в анализах бокового потока из-за нескольких особенностей. Нитроцеллюлозные мембраны поглощают белки в высокой концентрации. Растворитель, используемый для смачивания мембраны, не уменьшает абсорбцию белка нитроцеллюлозной мембраной. Нитроцеллюлозные мембраны можно легко разрезать до желаемого размера геля и переносить белки из геля в мембрану путем электрического или капиллярного переноса. Нитроцеллюлоза обеспечивает более быстрый поток белков через мембрану с высоким потенциалом связывания. Нитроцеллюлоза демонстрирует улучшенную прочность при обработке. Еще один особый атрибут нитроцеллюлозной мембраны заключается в том, что ее можно легко приклеить водостойким клеем, не содержащим растворителей, на различные пластиковые подложки..
Рисунок 01: нитроцеллюлозная мембрана для вестерн-блоттинга
Поливинилидендифторид (PVDF) является фторполимером, полученным путем полимеризации винилидендифторида, и обладает высокой иммобилизационной способностью белков. Поэтому микропористые мембраны, изготовленные из PVDF, используются в методах вестерн-блоттинга для анализа специфических белков из смесей белков. Мембраны PVDF также можно использовать для аминокислотного анализа и секвенирования белка. Наиболее важной характеристикой PVDF-мембраны над нитроцеллюлозной мембраной является то, что ее можно легко удалить с антител и использовать повторно для последующих исследований антител..
Мембраны из PVDF толще нитроцеллюлозных; следовательно, более устойчивы к повреждениям при повторном использовании. Мембраны из PVDF обладают высокой гидрофобностью. Поэтому перед употреблением их необходимо вымочить в метаноле или изопропаноле..
Нитроцеллюлоза против ПВДФ | |
Нитроцеллюлоза представляет собой полимер, состоящий из целлюлозы. | PVDF представляет собой фторполимер, полученный полимеризацией винилидендифторида. |
Размер пор мембраны | |
Типичные размеры пор 0,1, 0,2 или 0,45 мкм. | Типичные размеры пор 0,1, 0,2 или 0,45 мкм. |
Емкость связывания белка | |
Нитроцеллюлоза имеет белково-связывающую способность от 80 до 100 мкг / см.2. | PVDF обладает способностью связывать белок от 170 до 200 мкг / см.2. |
чувствительность | |
Это имеет низкую чувствительность по сравнению с PVDF. | Это имеет высокую чувствительность. |
Обнаружение малоэкспрессируемых белков | |
Поскольку чувствительность к нитроцеллюлозным мембранам низкая, она не подходит для обнаружения слабо экспрессируемых белков.. | Это больше подходит для обнаружения слабо экспрессируемых белков из-за его высокой чувствительности. |
Фоновый шум | |
Это имеет более низкий фоновый шум | Это имеет более высокий фоновый шум. |
Взаимодействие с белками | |
Молекулы белка связываются с нитроцеллюлозными мембранами посредством гидрофобных взаимодействий. | Белки связываются с мембранами PVDF через гидрофобные и дипольные взаимодействия. |
Природа Мембраны | |
Нитроцеллюлоза хрупкая и хрупкая. Тем не менее, существуют версии нитроцеллюлозы, и они устойчивы. | ПВДФ более долговечен и обладает большей химической стойкостью. |
Способность раздевать и повторно использовать | |
Нитроцеллюлоза может испытывать трудности при зачистке и повторном тестировании без потери сигнала.. | PVDF идеально подходит для приложений для ребробирования и секвенирования. |
годность | |
Нитроцеллюлоза идеально подходит для обнаружения низкомолекулярных белков. | PVDF больше подходит для обнаружения белков с более высокой молекулярной массой. |
Другое использование | |
Нитроцеллюлозу можно использовать для анализа нуклеиновых кислот и точечного / щелевого блоттинга. | PVDF может быть использован для секвенирования белка и систем твердофазного анализа. |
Стоимость | |
Это дешевле, чем мембраны PVDF. | Это дороже нитроцеллюлозных мембран. |
Необходимость предварительного смачивания | |
Нитроцеллюлозные мембраны не требуют предварительного замачивания метанолом | Мембраны PVDF требуют предварительного замачивания с метанолом. |
Нитроцеллюлозные мембраны были первыми коммерчески используемыми мембранами для анализа бокового потока. Они обладают высокой способностью поглощать белки. Поэтому нитроцеллюлозные мембраны используются в вестерн-блоттинге. PVDF является другим типом мембран, используемых в вестерн-блоттинге, и он также обладает высокой способностью абсорбировать белок. Оба типа используются в вестерн-блоттинге для анализа белка. Однако мембраны PVDF обладают более особыми свойствами, что делает их более подходящими, чем нитроцеллюлозные мембраны, для вестерн-блоттинга. Но нитроцеллюлозные мембраны больше подходят для обнаружения низкомолекулярных белков, мембраны PVDF больше подходят для обнаружения высокомолекулярных белков. В этом разница между нитроцеллюлозными и ПВДФ мембранами.
Изображение предоставлено:
1. «Передача вестерн-блоттинга» By Bensaccount из английский Википедия (CC BY 3.0) через Commons Wikimedia
Ссылка:
1.Люке-Гарсия, Хосе Л., Ге Чжоу, Тун-Тянь Сунь и Томас А. Нойберт. «Использование нитроцеллюлозных мембран для характеристики белка с помощью матричной лазерной десорбции / ионизационной масс-спектрометрии». Аналитическая химия. Национальная медицинская библиотека США, 15 июля 2006 г. Веб. 28 марта 2017
2. «Молекулярные маркеры и биотехнология растений». Google Книги. Н.п., н.д. Web. 28 марта 2017
3. Понедельник, 8 апреля 2013 г. Tweet. «Магия в мембране: мудро выбирай результаты Best Western Blot». Biocompare. Н.П., 8 апреля 2013 г. Интернет. 28 марта 2017