Разница между протеомикой и метаболомикой

ключевое отличие между протеомикой и метаболомикой протеомика - это изучение всех белков организма, а метаболомика - изучение всех метаболитов организма..

Геномика - это изучение генетической структуры организма. Протеомика и метаболомика - это две атомные науки, связанные с геномикой. Протеом относится ко всем белкам в клетке или организме. Метаболом, с другой стороны, относится ко всем метаболитам организма. Таким образом, изучение протеома является протеомикой, а изучение метаболома является метаболомикой. Как протеомика, так и метаболомика важны для диагностики заболеваний, а также для определения характеристик и скрининга организмов. Более того, оба связаны во многих аспектах клеточной биологии, особенно в клеточной передаче сигналов, деградации и генерации белка и посттрансляционной модификации..

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое протеомика
3. Что такое метаболомика
4. Сходство между протеомикой и метаболомикой
5. Сравнение бок о бок - протеомика против метаболомики в табличной форме
6. Резюме

Что такое протеомика?

Протеом - это общий белковый комплемент в клетке, ткани или организме. Поэтому протеомика - это изучение протеома организма. В протеомике анализируются различные характеристики белков. Поэтому протеомика в основном фокусируется на структуре, ориентации, функциях, взаимодействиях белков, модификациях, применениях и важности белков. Именно поэтому в настоящее время в области протеомики ведется множество исследовательских проектов..

Первые протеомные исследования были проведены для определения содержания белка в кишечной палочке. Картирование общего содержания белка проводили с использованием двумерных (2D) гелей. После успеха этого проекта ученые перешли к характеристике общего содержания белка у животных, таких как морские свинки и мыши. В настоящее время картирование белков человека осуществляется с помощью 2D гель-электрофореза..

Есть много преимуществ изучения протеомики, так как белки являются управляющими молекулами большей активности благодаря каталитическому свойству белков. Таким образом, изучение целых белков может предоставить информацию о состоянии здоровья организма. Кроме того, протеомика имеет множество применений в аннотации генома, идентификации и диагностике заболеваний, проведении исследований экспрессии белка во время экспериментов, модификаций белка и исследований взаимодействия и т. Д..

Рисунок 01: Протеомика

Существуют различные методы, связанные с протеомикой, в том числе извлечение общего белка, разделение их с помощью 2D гель-электрофореза, секвенирование экстрагированных белков с использованием таких методов, как метод секвенирования Эдмунда или масс-спектрометрия и анализ структурных и функциональных свойств белка с использованием компьютерное программное обеспечение и инструменты биоинформатики.

Что такое метаболомика?

Метаболомика - это изучение всех метаболитов в клетке, ткани или организме. Он включает идентификацию и количественную оценку клеточных метаболитов с использованием различных современных аналитических и статистических инструментов. Метаболомика является важным исследованием, поскольку она раскрывает информацию о метаболизме организма..

Рисунок 02: Метаболомика

Для изучения субстратов и продуктов метаболических реакций метаболомика использует масс-спектрометрию в качестве аналитической платформы. Масс-спектрометрия приводит к метаболитам и их концентрациям, отражая фактическое биохимическое состояние клеток или тканей. Следовательно, метаболомика может рассматриваться как лучшее представление молекулярного фенотипа организма. В дополнение к этому, метаболомика может рассматриваться как продолжение протеомики, потому что большинство метаболитов генерируется из-за активности ферментов, которые являются белками.

Каковы сходства между протеомикой и метаболомикой?

• Протеомика и метаболомика - две атомные науки, связанные с геномикой.
• Метаболомика может рассматриваться как продолжение протеомики.
• Протеом и метаболом тесно переплетены со многими исследованиями.

В чем разница между протеомикой и метаболомикой?

Протеомика - это широкомасштабное исследование белков, в том числе их структуры и функций, в клетке или организме. Между тем, метаболомика - это изучение профилей метаболитов в клетке, ткани или организме при заданном наборе условий. Итак, в этом ключевое отличие протеомики от метаболомики. Кроме того, протеомика главным образом касается полного набора белков, в то время как метаболомика главным образом касается полного набора метаболитов, включая разнообразные небольшие молекулы, такие как пептиды, углеводы, липиды, нуклеозиды и катаболические продукты экзогенных соединений и т. Д. Следовательно, это другое различие между протеомикой и метаболомикой.

Приведенная ниже инфографика суммирует разницу между протеомикой и метаболомикой.

Резюме - Протеомика против метаболомики

Живые организмы могут быть изучены с использованием их генома, белков и метаболитов. Геномика, протеомика и метаболомика - это три области, которые изучают генетический состав, белки и метаболиты клетки или организма, соответственно. Протеомика важна, поскольку она является динамическим отражением как генов, так и окружающей среды. Метаболомика очень важна, поскольку она непосредственно отражает текущее состояние биохимической реакции клеток или метаболический статус организма. Таким образом, это суммирует разницу между протеомикой и метаболомикой.

Ссылка:

1. П, Сурат. «Как связаны метаболом и протеом?» Новости, 26 февраля 2019, доступно здесь.
2. Хорган, Ричард П и Луиза Кенни. «Обзор SAC« Омические »технологии: геномика, транскриптомика, протеомика и метаболомика». Акушерство и гинекология, John Wiley & Sons, Ltd (10.1111), 18 июля 2011 г., доступно здесь.

Изображение предоставлено:

1. «Протеомика» Xxl7441 на английском Wikibooks - перенесено из en.wikibooks в Commons. (Общественное достояние) через Wikimedia Commons
2. «Схема метаболомики» Lmaps (доклад) - я создал эту работу сам (CC BY-SA 3.0) через Commons Wikimedia