Разница между протеомикой и транскриптомикой

Ключевое отличие - протеомика против транскриптомики
 

Атомная технология является современной тенденцией, когда различные биомолекулы организма рассматриваются как единое целое с точки зрения его свойств и функций. У атомной технологии есть широкий спектр применений. Различные омики биологического образца включают геномику, протеомику, транскриптомику и метаболомику. Протеомика предполагает полное изучение всех белков в живом организме. Он определяется как совокупность всех экспрессируемых белков в организме, его структурных и функциональных свойств. Полный набор белков, следовательно, образуют протеом. Транскриптомика - это полное изучение всех молекул РНК (мРНК), присутствующих в живом организме. Таким образом, транскриптомика имеет дело с генами, которые активно экспрессируются в живом организме. Общий набор мРНК в живом организме называется транскриптомом. ключевое отличие между протеомикой и транскриптомикой основан на типе биомолекулы. В протеомике изучается общий набор экспрессированных белков в живом организме, тогда как в транскриптомике изучается общая мРНК живого организма..

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое протеомика
3. Что такое транскриптомика
4. Сходство между протеомикой и транскриптомикой
5. Сравнение бок о бок - протеомика против транскриптомики в табличной форме
6. Резюме

Что такое протеомика?

Термин протеомика был введен в 1995 году и первоначально был определен как общий белковый комплемент в клетке, ткани или организме. С развитием протеомных исследований он был изменен, чтобы его можно было рассматривать как общий термин, в который были включены многие области исследований. В настоящее время под темой протеомики изучаются структура, ориентация, функции, его взаимодействия, его модификации, его применения и важность белков. Поэтому в настоящее время проводится много исследований в области протеомики..

Первые протеомные исследования были проведены для определения содержания белка в кишечная палочка. Картирование общего содержания белка проводили с использованием двумерных (2D) гелей. После этого ученые перешли к характеристике общего содержания белка у животных, таких как морские свинки и мыши. В настоящее время картирование белков человека осуществляется с помощью 2D гель-электрофореза..

Применение протеомики

Есть много преимуществ изучения протеомики, так как белки являются управляющими молекулами большей части активности благодаря каталитическому свойству белков. Таким образом, изучение целых белков может предоставить информацию о состоянии здоровья организма. Некоторые приложения есть;

1. Геномная аннотацияИзучая содержание белка в организме, можно определить точные геномы, ответственные за активное соединение белка. В этом сценарии важны результаты всей геномики, транскриптомики и протеомики..
2. Идентификация болезни / Диагностика: Протеомика используется для идентификации состояния заболевания путем сравнения здоровых и больных
3. Выполнять экспрессия белка учился во время экспериментов.
4. Модификации белка и исследования взаимодействия: Чтобы использовать белки в витро условия или и в естественных условиях условия, чтобы решить условия хранения этих экстрагированных белков и изучить поведение белка в в пробирке, в естественных условиях и in-silico методы.

Рисунок 01: Протеомика

Существуют разные методы, связанные с протеомикой

1. Экстракция общего белка и разделение белков с помощью 2D гель-электрофореза. Белки также могут быть разделены с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ).
2. Секвенирование экстрагированных белков с использованием таких методов, как метод секвенирования Эдмунда или масс-спектрометрия.
3. Как только последовательности определены, структурные и функциональные свойства содержания белка анализируются с использованием компьютерного программного обеспечения и инструментов биоинформатики..

Что такое транскриптомика?

Термин транскриптом был придуман недавно. Транскриптомика - это исследование общего содержания мРНК в организме. Общая мРНК - это экспрессированная ДНК в живом организме или клетке. Полная коллекция мРНК упоминается как транскриптом.

Этапы анализа транскриптома включают,

1. Экстракция РНК, отделение мРНК с помощью колоночной гель-хроматографии с шариками Poly DT.
2. Секвенирование мРНК сделано.

Технология микрочипов является одним из распространенных способов идентификации транскриптома организма. Метод микроматрицы включает в себя зондовую пластину с комплементарными цепями транскриптома После гибридизации мРНК, присутствующая в организме или клетках, может быть охарактеризована.

Рисунок 02: Транскриптомные методы

Транскриптомика сейчас широко используется в медицинской сфере. Диагностика заболеваний и профилирование заболеваний являются основными областями, в которых используется транскриптомика. Анализируя транскриптом организма, можно идентифицировать чужеродную мРНК, и, если есть какие-либо инфекции, ее можно идентифицировать. Некодирующая РНК может быть разделена с использованием транскриптомных технологий. А также можно контролировать экспрессию генов при различных стрессах окружающей среды.

 Каковы сходства между протеомикой и транскриптомикой?

• Оба составляют часть концепции атомной технологии.
• Оба используются в диагностике заболеваний и характеристиках заболеваний организма.
• Обе области исследования включали извлечение биомолекулы, разделение биомолекулы и этапы секвенирования.

В чем разница между протеомикой и транскриптомикой?

Protemics против транскриптомики
Протеомика включает в себя полное изучение всех белков в живом организме..	Транскриптомика - это полное изучение всех молекул РНК (мРНК), присутствующих в живом организме..
Изучил био тип молекулы
Белки изучаются в протеомике.	мРНК изучаются в транскриптомике.
Изученные факторы
Структура, функции, взаимодействия, модификации и применения белков изучаются в протеомике.	Структура последовательности, взаимодействия с окружающей средой и применение мРНК изучаются в транскриптомике.

Основная информация - протеомика против транскриптомики 

Омики играют важную роль в области наук о жизни. Протеомика относится к изучению протеома, который формирует полные коллекции белков в клетке или организме. Транскриптомика относится к изучению транскриптома, который представляет собой полный набор экспрессируемой ДНК, которая находится в форме мРНК. Две области исследования, протеомика и транскриптомика, были получены после введения геномики и в настоящее время широко используются в медицинской диагностике, а также для определения характеристик и скрининга организмов. В этом разница между протеомикой и транскриптомикой.

Скачать PDF протеомики против транскриптомики

Вы можете скачать PDF-версию этой статьи и использовать ее в автономном режиме согласно примечанию. Пожалуйста, загрузите PDF версию здесь: Разница между протеомикой и транскриптомикой

Ссылка:

1.Хорган, Ричард П. и Луиза С. Кенни. «Омические» технологии: геномика, транскриптомика, протеомика и метаболомика ». Акушер и гинеколог, Blackwell Publishing Inc, 18 июля 2011 г. Доступно здесь  
2. Грейвс, Пол Р. и Тимоти А. Дж. Хейстед. «Руководство молекулярного биолога по протеомике». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии, Американское общество микробиологии, март 2002 г. Доступно здесь
3. Лоу, Рохан и др. «Транскриптомные технологии». PLoS Компьютерная биология, Публичная библиотека науки, май 2017 г. Доступно здесь  

Изображение предоставлено:

1. «Proteomics» от Xxl7441 на английском Wikibooks - перенесено из en.wikibooks в Commons., (Public Domain) через Commons Wikimedia
2. «Микрочип и секвенирующая проточная кювета». Томас Шафи - собственная работа (CC BY 4.0) с помощью Commons Wikimedia