Рибонуклеазы - это нуклеазы, которые специфически разлагают РНК на более мелкие единицы. Их можно разделить на две категории; эндорибонуклеазы и экзорибонуклеазы. Эндорибонуклеаза представляет собой эндонуклеазу, которая может разрушать одноцепочечную или двухцепочечную РНК. Он расщепляет фосфодиэфирные связи внутри полинуклеотидной цепи РНК. Примерами являются РНКаза А, РНКаза III, РНКаза Т1, РНКаза Р и РНКаза Н. Экзорибонуклеаза представляет собой экзонуклеазу, которая разрушает РНК путем удаления концевых нуклеотидов либо с 5'-конца, либо с 3'-конца молекулы РНК. Примерами являются РНКаза R, РНКаза II, РНКаза D и РНКаза PH. ключевое отличие между RNASE A и RNASE H является то, что РНКаза А представляет собой рибонуклеазу поджелудочной железы, которая специфически разлагает одноцепочечную РНК на более мелкие компоненты, в то время как РНКаза Н представляет собой неспецифический фермент, который расщепляет РНК в гибриде РНК-ДНК на более мелкие единицы посредством гидролитического механизма..
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое RNASE A
3. Что такое RNASE H
4. Сходства между RNASE A и RNASE H
5. Сравнение бок о бок - RNASE A против RNASE H в табличной форме
6. Резюме
РНКаза А представляет собой рибонуклеазу поджелудочной железы, которая специфически расщепляет непарные остатки цитозина и урацила на 3'-конце одноцепочечной РНК. РНКаза Н работает при более высокой концентрации соли (0,3 М или более высокой концентрации NaCl). Гидролитическая реакция состоит из двух этапов. Он образует 3 'фосфорилированный продукт через 2', 3 'циклический монофосфатный промежуточный продукт. Хотя он специфичен для одноцепочечной РНК при более высокой концентрации соли, он также может разлагать двухцепочечную РНК и РНК в гибриде РНК-ДНК при более низкой концентрации NaCl (ниже 0,3 М NaCl).
Брюс Меррифилд впервые синтезировал этот фермент. РНКаза А является очень популярным ферментом в молекулярных исследованиях. РНКаза А поджелудочной железы крупного рогатого скота является примером РНКазы А. И это один из самых стойких ферментов, которые используются в лаборатории. Этот фермент не нуждается в кофакторе для своей активности. Это высокостабильный фермент. РНКаза А является первым ферментом и третьим белком, для которого была обнаружена правильная аминокислотная последовательность. Этот фермент очень маленький с 124 аминокислотами и молекулярной массой 12600da. И у него есть четыре остатка гистидина (His 12 и His 119, которые участвуют в каталитической реакции).
Рисунок 01: РНКаза А
РНКаза А может быть выделена путем кипячения неочищенного образца. Когда кипит, все другие ферменты разрушают оставшуюся РНКазу А. РНКаза А является удивительно стабильным ферментом. Этот фермент ингибирует вместе с белком-ингибитором рибонуклеазы комплексы тяжелых металлов и уридин-ванадата.
РНКаза Н представляет собой неспецифический рибонуклеазный фермент, который может разрушать РНК в гибриде РНК-ДНК посредством гидролитической реакции. РНКаза H расщепляет 3'-O-P связь РНК в гибриде РНК-ДНК. В конечном итоге он производит 3'OH и 5'-продукты с фосфатным окончанием. В репликации ДНК он играет ключевую роль, удаляя РНК-праймер после образования новых цепей ДНК. В лабораторных условиях он специфически разлагает РНК в гибриде РНК-ДНК, но не ДНК и негибридизованную РНК. И этот фермент обычно используется для разрушения матрицы РНК после образования первой комплементарной цепи ДНК во время синтеза кДНК..
Рисунок 02: РНКаза Н
РНКаза Н также используется в анализах защиты от нуклеаз. Он также может быть включен в удаление поли А хвоста из мРНК. РНКаза Н обладает способностью разрушать некодирующую РНК внутри и снаружи клетки. Ионы металлов необходимы в качестве кофакторов для этой активности белка. Хелатор (ЭДТА) может быть использован для ингибирования фермента РНКазы Н.
RNASE A против RNASE H | |
РНКаза А представляет собой рибонуклеазу поджелудочной железы, которая специфически расщепляет 3'-конец непарных остатков цитозина и урацила одноцепочечной РНК при более высокой концентрации соли. | РНКаза Н является неспецифическим ферментом рибонуклеазой, который может разрушать РНК в гибриде РНК-ДНК посредством гидролитической реакции.. |
Природа расщепления РНК | |
РНКаза А специфически расщепляет одноцепочечную РНК при более высокой концентрации соли. | РНКаза Н расщепляет РНК в гибрид РНК-ДНК. |
Потребность в ко-факторах для деятельности | |
РНКаза А не нуждается в кофакторах для своей активности. | РНКаза Н нуждается в ионах металлов в качестве кофакторов для своей активности. |
Ингибиторы белковой активности | |
Белковые ингибиторы рибонуклеазы, комплексы тяжелых металлов и уридин-ванадата ингибируют активность РНКазы А. | Хелатор (ЭДТА) ингибирует активность РНКазы Н. |
Удаление праймера РНК при репликации ДНК | |
РНКаза А не используется для удаления праймера РНК при репликации ДНК. | РНКаза Н используется для удаления праймера РНК при репликации ДНК |
Удаление ДНК-матрицы в синтезе дополнительной ДНК (С-ДНК) | |
РНКаза А не используется для удаления матрицы РНК во время синтеза комплементарной ДНК (С-ДНК). | РНКаза Н используется для удаления матрицы РНК во время синтеза комплементарной ДНК (С-ДНК). |
Удаление Poly-A-Tail в мРНК, гибридизированной с олиго (dt) | |
РНКаза А не используется для удаления «хвоста поли-А» в мРНК, гибридизованной с олиго (dt). | РНКаза Н используется для удаления «поли-А-хвоста» в мРНК, гибридизованной с олиго (dt) |
Рибонуклеазы - это нуклеазные ферменты, которые способны расщеплять РНК на более мелкие единицы. Они двух типов; эндорибонуклеазы и экзорибонуклеазы. Эндорибонуклеаза представляет собой эндонуклеазу, которая обладает способностью разрушать одноцепочечную или двухцепочечную РНК. И он расщепляет фосфодиэфирную связь внутри полинуклеотидной цепи РНК. РНКаза А и РНКаза Н являются двумя эндорибонуклеазами. РНКаза А представляет собой рибонуклеазу поджелудочной железы, которая специфически расщепляет непарные остатки цитозина и урацила на 3'-конце одноцепочечной РНК при более высокой концентрации соли. РНКаза Н является неспецифическим ферментом рибонуклеазой, который может разрушать РНК в гибриде РНК-ДНК посредством гидролитической реакции. В этом разница между РНКазой А и РНКазой Н.
Вы можете скачать PDF версию этой статьи и использовать ее в автономном режиме, как указано в примечании. Пожалуйста, загрузите PDF версию здесь Разница между RNASE A и RNASE H
1.Карутури, Автор Амрута. «17 нужно знать факты о RNase A.» Блог AG, 22 февраля 2017 г. Доступно здесь
2. «рибонуклеазы.» Википедия, Фонд Викимедиа, 5 января 2018 г. Доступно здесь
1.'RNase A'By. Нет машиночитаемого автора. Предположительно Vossman (основываясь на заявлении об авторском праве). (CC BY-SA 2.5) через Commons Wikimedia
2. 'RNase H fix'By' Не предоставлено машиночитаемого автора. Предположительно Vossman (основываясь на заявлении об авторском праве). (CC BY-SA 2.5) через Commons Wikimedia