Термины укладывающий гель и разделяющий гель используются при объяснении технологии SDS-PAGE. SDS-PAGE или электрофорез в додецилсульфат-полиакриламидном геле натрия представляет собой лабораторный метод, который используется для разделения молекул белка в зависимости от их молекулярного веса. Теория, лежащая в основе метода, заключается в том, что белки с разной молекулярной массой показывают разные скорости миграции; молекулы с низкой молекулярной массой мигрируют быстрее, тогда как молекулы с высокой молекулярной массой мигрируют медленно. Средой для миграции является гель. Есть два типа гелей, названных как укладывающий гель и разделяющий гель. ключевое отличие между укладывающим гелем и разделяющим гелем является то, что рН укладывающего геля составляет 6,8, тогда как рН разделяющего геля составляет 8,8.
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое укладывающий гель
3. Что такое разделительный гель
4. Связь между укладывающим гелем и разделяющим гелем
5. Сравнение бок о бок - укладывающийся гель против разделяющего геля в форме таблицы
6. Резюме
Укладочный гель представляет собой низкоконцентрированный полиакриламидный гель, который помещают поверх более концентрированного разделяющего геля (разделяющий гель) в методике SDS-PAGE. Укладочный гель используется для улучшения разрешения электрофореза. Разрешение увеличивается из-за разницы между концентрациями укладывающего геля и разделяющего геля, которые влияют на белки в образце. Поскольку концентрация полиакриламида в штабелирующем геле низкая, размер пор выше. Это также помогает в увеличении разделения.
Укладочный гель представляет собой рыхлый полиакриламидный гель с большими порами, примерно 7% полиакриламида. Эти поры не действуют как существенный барьер для больших белковых молекул. Следовательно, этот гель слегка влияет на подвижность этих белков. Это делает разделение в соответствии с подвижностью и размером белка, концентрируя их между двумя гелями.
Рисунок 01: SDS-PAGE Акриламидный гель
РН укладывающего геля составляет 6,8. Его pH более кислый, чем растворение геля на 2 единицы pH. Этот рН подразумевает более низкую ионную силу, следовательно, более высокое электрическое сопротивление. Это провоцирует подвижность белков, чем других заряженных частиц, присутствующих в геле.
Разделительный гель или разделительный гель SDS-PAGEtechnique представляет собой высококонцентрированный полиакриламидный гель, который наносится поверх низкоконцентрированного укладывающего геля. Разделительный гель содержит большое количество полиакриламида (10%). PH этого геля поддерживается на уровне pH = 8,8, что является более высоким уровнем pH, чем у укладывающего геля.
Рисунок 02: Аппарат для гель-электрофореза
Когда молекулы белка достигают разделяющего геля, миграция этих молекул замедляется, потому что разделяющий гель представляет собой высококонцентрированный гель с небольшим размером пор, который может служить значительным барьером для движения молекул белка. Это замедление позволяет другим белкам медленно мигрировать, чтобы догнать, что приводит к узкой, концентрированной полосе между двумя гелями.
Укладочный гель против разделяющего геля | |
Укладочный гель представляет собой низкоконцентрированный полиакриламидный гель, который помещают поверх более концентрированного разделяющего геля (разделяющий гель) в методике SDS-PAGE.. | Разделительный гель или разделительный гель по методике SDS-PAGE представляет собой высококонцентрированный полиакриламидный гель, который помещают поверх низкоконцентрированного укладывающего геля.. |
размещение | |
Укладывающий гель наносится на разделяющий гель. | Разделительный гель помещают на дно контейнера, используемого для гель-электрофореза. |
концентрация | |
Концентрация укладывающего геля высокая. | Концентрация разделяющего геля низкая. |
Содержание полиакриламида | |
Укладочный гель содержит около 7% полиакриламида. | Разделительный гель содержит около 10% полиакриламида. |
pH | |
РН укладывающего геля составляет 6,8. | РН разделяющего геля составляет 8,8. |
Размер пор | |
Большие размеры пор присутствуют в укладывающем геле. | Небольшие размеры пор присутствуют в разделяющем геле. |
разрешение | |
Укладывающий гель дает лучшее разрешение. | Разделение геля дает плохое разрешение. |
Укладочный гель и разделяющий гель представляют собой два типа полиакриламидных гелей, используемых для лучшего разделения молекул белка в данном образце. Разница между укладывающим гелем и разделяющим гелем заключается в том, что рН укладывающего геля составляет 6,8, тогда как рН разделяющего геля составляет 8,8..
1. «Электрофорез в полиакриламидном геле». Электрофорез в полиакриламидном геле (Теория): Виртуальная лаборатория молекулярной биологии. II: Биотехнология и биомедицинская инженерия: Виртуальная лаборатория Амриты Вишвы Видьяпетама. Доступна здесь
2. «Как работает SDS-PAGE» Bitesize Bio, 16 февраля 2018 г. Доступно здесь
3. «Укладочный гель SDS-PAGE - BICH 608 (Polymenis-Pettigrew)». Сайты Google. Доступна здесь
1. 'SDS-PAGE Акриламидный гель' Bensaccount из английский Википедия, (CC BY 3.0) через Commons Wikimedia
2. «Аппарат для гель-электрофореза» Джеффри М. Винокур - собственная работа, (CC-BY 2.5) через Commons Wikimedia