Разница между секвенированием всего генома и секвенированием экзома

ключевое отличие между секвенированием всего генома и секвенированием экзома является то, что секвенирование всего генома последовательности всего генома организма, в то время как последовательность секвенирования экзома только экзома или кодирующие белок гены организма.

Секвенирование - это метод, который определяет точный порядок нуклеотидов в конкретной молекуле ДНК. Это просто отражает правильный порядок четырех оснований; аденин (A), гуанин (G), цитозин (C) и тимин (T) в фрагменте ДНК. Существует несколько методов секвенирования, таких как секвенирование Сангера, секвенирование следующего поколения и т. Д. Кроме того, секвенирование может проходить либо полный геном организма (секвенирование всего генома), либо только кодирующие белок гены в геноме (секвенирование экзома).

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое секвенирование всего генома
3. Что такое Exome Sequencing
4. Сходства между секвенированием всего генома и секвенированием экзома
5. Сравнение бок о бок - секвенирование всего генома против секвенирования экзома в табличной форме
6. Резюме

Что такое секвенирование всего генома?

Геном человека содержит почти три миллиарда пар оснований ДНК. Секвенирование всего генома является методом, который секвенирует полный геном организма. Следовательно, при секвенировании всего генома, речь идет о всей коллекции молекул ДНК, включая экзомы, интроны, межгенные пространства и т. Д. Кроме того, последовательности секвенирования всего генома не только генома, который находится внутри ядра, но также и митохондриальной ДНК..

Рисунок 01: Секвенирование всего генома

При подготовке к этому секвенированию первым шагом является извлечение всей ДНК. Затем извлеченная ДНК подвергается процедуре секвенирования с использованием подходящего метода секвенирования. Анализируя полученные последовательности, используя инструмент биоинформатики, мы можем обнаружить редкие заболевания, рак, инфекционные заболевания и т. Д..

Что такое Exome Sequencing?

Exome является частью генома, который содержит около 1,5% генома, и это коллекция экзонов. Экзоны - это последовательности, которые транскрибируются в мРНК, а затем в конечный белковый продукт. Следовательно, exome секвенирует последовательности целых кодирующих белок последовательностей в геноме. Секвенирование Exome выявляет генетические нарушения, так как большинство генетических нарушений возникают из-за мутаций генов, кодирующих белок. Следовательно, диагностические процессы генетических нарушений часто используют секвенирование экзома в качестве метода диагностики заболевания. Кроме того, при сравнении с полным приложением секвенирования генома для генетического тестирования, секвенирование экзома занимает меньше времени и дешевле..

Рисунок 02: Exome Sequencing

При секвенировании экзома, во-первых, необходимо выбирать только последовательности, кодирующие белок, из общей ДНК. Обратите внимание, что люди имеют около 180000 последовательностей, кодирующих белки. Затем exome секвенируют, используя метод секвенирования с высокой пропускной способностью..

Каковы сходства между секвенированием всего генома и секвенированием экзома?

• Полное секвенирование генома и секвенирование экзома - два применения секвенирования.
• Оба метода полезны для определения правильного порядка нуклеотидной последовательности в обоих методах..
• Кроме того, биоинформатика помогает в обоих методах для анализа данных.

В чем разница между секвенированием всего генома и секвенированием экзома?

Секвенирование всего генома последовательности всей ДНК генома организма, в то время как последовательность секвенирования экзома только последовательности, кодирующие белок из генома. Следовательно, это принципиальное различие между секвенированием всего генома и секвенированием экзома. Кроме того, хотя оба метода широко используются для определения правильного порядка нуклеотидной последовательности, полное секвенирование генома является дорогостоящим и трудоемким, чем секвенирование экзома.

Приведенная ниже инфографика приводит таблицу различий между секвенированием всего генома и секвенированием экзома.

Резюме - секвенирование всего генома против секвенирования экзома

Секвенирование показывает точный порядок оснований во фрагменте ДНК, и это может быть либо секвенирование всего генома, либо секвенирование экзома. Здесь последовательность секвенирования всего генома является полным геномом организма, тогда как последовательность секвенирования экзома представляет собой только кодирующие белок последовательности в геноме. Учитывая их применение, секвенирование всего генома полезно при анализе генетических аберраций, таких как вариации отдельных нуклеотидов, делеции, вставки и т. Д. В целом геноме, в то время как секвенирование экзома полезно при обнаружении генетических заболеваний. Следовательно, это разница между секвенированием всего генома и секвенированием экзома.

Ссылка:

1. «Секвенирование целого генома против секвенирования целого экзома против целевых панелей секвенирования». Healio, SLACK Incorporated. Доступна здесь  
2. «Что такое секвенирование всего экзома и секвенирование всего генома? - Домашний Справочник Генетики - NIH. ” Национальная медицинская библиотека США, Национальные институты здравоохранения. Доступна здесь  

Изображение предоставлено:

1. «Секвенирование всего генома по сравнению с иерархическим секвенированием». Commins, J., Toft, C., Fares, M.A. - «Методы вычислительной биологии и их применение к сравнительной геномике внутриклеточных симбиотических бактерий насекомых». (CC BY-SA 2.5) через Commons Wikimedia  
2. «Рабочий процесс Exome Sequencing 1a» от SarahKusala - собственная работа (CC BY 3.0) через Commons Wikimedia