Разница между активным сайтом и сайтом связывания

ключевое отличие между активным сайтом и сайтом связывания является то, что активный сайт способствует катализу химической реакции, тогда как сайт связывания способствует связыванию лиганда с большой молекулой.

Сайт связывания представляет собой область на белке, ДНК или РНК, с которой может связываться лиганд. Ферменты - это белки. Активный сайт - это область на ферменте, с которой субстраты могут связываться, чтобы подвергнуться химической реакции. Этот специфический регион также имеет сайт связывания наряду с каталитическим сайтом. Следовательно, сайты связывания помогают только в связывании лиганда с большой молекулой, тогда как активные сайты способствуют как связыванию лиганда с большой молекулой, так и позволяя ему подвергаться каталитической химической реакции..

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое активный сайт
3. Что такое сайт связывания
4. Сравнение бок о бок - активный сайт против сайта связывания в табличной форме
5. Резюме

Что такое активный сайт?

Активный сайт представляет собой область на ферменте, с которой связываются субстраты химической реакции, чтобы подвергнуться каталитической химической реакции. этот регион состоит из двух субрегионов в качестве сайта связывания и каталитического сайта. Сайт связывания содержит некоторые остатки, которые могут способствовать связыванию субстрата (реагентов) с ферментом. Каталитический сайт помогает в катализе химической реакции. Кроме того, эта область очень мала по сравнению со всем объемом фермента; примерно 10-20% от всего объема фермента.

Рисунок 01: Сайт связывания и каталитический сайт активного сайта

Обычно активный сайт содержит 3-4 аминокислоты. остальные аминокислоты в ферменте участвуют в поддержании третичной структуры фермента. Что еще более важно, активный сайт имеет определенный дизайн, который может соответствовать конкретной подложке. Следовательно, эти ферменты реагируют только с конкретными субстратами. Но иногда ферментам нужны кофакторы для их функционирования. Основная функция активного сайта состоит в том, чтобы уменьшить энергию активации химической реакции, таким образом, чтобы увеличить скорость реакции.

Что такое сайт привязки?

Сайт связывания представляет собой область на белке, ДНК или РНК, с которой могут связываться лиганды. Там лиганд может образовывать химическую связь с этим сайтом. Эти регионы показывают специфичность; определенный лиганд будет связываться с конкретным сайтом связывания. Следовательно, этот сайт является мерой типов лигандов, которые могут связываться с молекулой..

Кроме того, мы часто используем эти области для функциональной характеристики биомолекул. Например, мы можем охарактеризовать функциональность активного сайта через его сайт привязки. Более того, в случае ДНК специфическим типом сайта связывания является сайт связывания фактора транскрипции, присутствующий на ДНК.

В чем разница между активным сайтом и сайтом связывания?

Активный сайт представляет собой область на ферменте, с которой связываются субстраты химической реакции для того, чтобы подвергнуться каталитической химической реакции, тогда как сайт связывания представляет собой область на белке, ДНК или РНК, с которой могут связываться лиганды. Это ключевое различие между активным сайтом и сайтом связывания. Кроме того, активные центры присутствуют на ферментах, и они помогают увеличить скорость реакции конкретной химической реакции посредством уменьшения энергетического барьера активации этой реакции. Сайты связывания, с другой стороны, ответственны за связывание определенного лиганда с конкретной молекулой.

Приведенная ниже инфографика представляет разницу между активным сайтом и сайтом связывания в табличной форме..

Резюме - Активный сайт против сайта привязки

Активные сайты представляют собой области на ферментах, которые могут увеличить скорость химической реакции путем снижения энергетического барьера активации этой реакции. Сайт связывания представляет собой любую область, с которой может связываться лиганд. Активный сайт также содержит обязательный сайт. Разница между активным сайтом и сайтами связывания заключается в существовании и функциональности. Следовательно, ключевое различие между активным сайтом и сайтом связывания заключается в том, что активный сайт помогает катализу химической реакции, тогда как сайт связывания способствует связыванию лиганда с большой молекулой..

Ссылка:

1. «Активный сайт». Википедия, Фонд Викимедиа, 24 июля 2018 года. Доступно здесь 
2. «Место привязки». Википедия, Фонд Викимедиа, 28 августа 2018 г. Доступно здесь 

Изображение предоставлено:

1. «Структура фермента» Томас Шафи - собственная работа (CC BY 4.0) через Commons Wikimedia