SDS и нативная страница представляют собой два типа методов электрофореза в полиакриламидном геле, используемые в молекулярной биологии. ключевое отличие между SDS Page и Native Page - тип используемого полиакриламидного геля. На странице SDS используется денатурирующий гель, поэтому молекулы разделяются в зависимости от их молекулярной массы. Напротив, в Native Page используются неденатурирующие гели. Следовательно, молекулы разделяются в зависимости от их размера, заряда и формы..
Электрофорез в полиакриламидном геле (Page) использует гель, полученный путем полимеризации акриламидных мономеров с метиленбисакриламидом. Полиакриламид является более жестким и более термостойким, чем агароза. Полиакриламидные гели имеют меньший размер пор, что обеспечивает эффективное разделение белков. Существует два основных типа настроек страницы, а именно: SDS Page и Native Page. Страница SDS или Электрофорез в полиакриламидном геле с натрий-додецилсульфатом разделяет белки на основе их молекулярного веса. Денатурирующие гели используются в SDS. Native Page использует неденатурирующие гели и разделяет белки в зависимости от их размера, заряда и формы (трехмерная конформация)..
1. Обзор и основные отличия
2. Что такое SDS Page
3. Что такое Native Page
4. Сходства между SDS Page и Native Page
5. Сравнение бок о бок - страница SDS и собственная страница в табличной форме
6. Резюме
SDS Page является наиболее распространенной электрофоретической техникой, используемой для разделения белков в зависимости от их молекулярной массы. Гель получают путем добавления SDS (додецилсульфата натрия), который является моющим средством. SDS протезирует белки в мономеры. SDS является анионным моющим средством. Следовательно, он добавляет чистый отрицательный заряд к белкам в широком диапазоне рН. Когда суммарный отрицательный заряд передается молекулам белка из-за изменения заряда, сложные структуры разрушаются. Благодаря отрицательному заряду, белки притягиваются к положительному концу. Таким образом, молекулы с более низкой молекулярной массой быстрее перемещаются по матрице геля и могут наблюдаться вблизи анода, тогда как белки с более высокой молекулярной массой наблюдаются ближе к лункам..
Рисунок 01: Страница SDS
Связывание SDS с полипептидной цепью пропорционально ее относительной молекулярной массе. Следовательно, молекулярная масса также может быть определена с помощью SDS. Окрашивание гелей SDS Page производится окрашиванием бромфеноловым синим. Область применения SDS-страниц в большей степени варьируется, когда ее можно использовать для оценки относительной молекулярной массы и для определения относительного содержания белков в белковой смеси. SDS Page также можно использовать для определения распределения белков в смеси белков. SDS Page также применяется для очистки и оценки белков. Он используется в качестве предварительной процедуры для вестерн-блоттинга и гибридизации, которая, в свою очередь, используется для картирования и идентификации белка..
Электрофорез в нативном полиакриламидном геле (Native Page) использует неденатурирующий гель. Следовательно, SDS или любой другой денатурирующий агент не добавляют в матрицу геля. В Native Page разделение белков основано на заряде и размере белка. Следовательно, подвижность белка зависит от заряда и размера белка.
Заряд белка зависит от боковых цепей аминокислот. Если боковые цепи заряжены отрицательно, белок получит общий отрицательный заряд, и наоборот. Белки сохраняют трехмерную конформацию благодаря сворачиванию, которое происходит. Складывание происходит из-за нескольких типов связей в белках, таких как дисульфидные связи, гидрофобные взаимодействия и водородные связи. Следовательно, если нативная страница переносится при нейтральном pH, белки будут разделены в соответствии с молекулярной формой белка. Следовательно, Native Page можно использовать в качестве чувствительного метода для определения изменения заряда или конформации белка..
Основным преимуществом нативной страницы является то, что белок, используемый для анализа страницы, может быть восстановлен в своем первоначальном состоянии после анализа страницы, так как белок не нарушается во время процесса. Native Page - метод с относительно высокой пропускной способностью, и стабильность белка повышена.
Рисунок 02: Родная страница
После завершения прогона геля Native Page гель можно наблюдать, окрашивая бромфеноловым синим или любым другим подходящим окрашивающим реагентом. Применение Native Page включает в себя разделение кислых белков, включая гликопротеины, такие как человеческий рекомбинантный эритропоэтин, или идентификацию белков, присутствующих в бычьем сывороточном альбумине (BSA)..
Страница SDS против родной страницы | |
Страница SDS или страница натрия-додецилсульфата разделяет белки в зависимости от их молекулярной массы и использует денатурирующий гель. | Native Page использует неденатурирующие гели и разделяет белки в зависимости от их размера, заряда и формы (трехмерная конформация).. |
Тип геля | |
На SDS-странице используется денатурирующий гель. | Неденатурирующий гель используется на родной странице. |
Наличие SDS | |
SDS присутствует в качестве моющего средства для придания отрицательного заряда образцу на странице SDS. | SDS нет на родной странице. |
Основа разделения | |
Разделение белков зависит от молекулярной массы белка на странице SDS. | Разделение зависит от размера и формы молекулы белка на нативной странице.. |
Стабильность белка | |
Стабильность белка низкая на странице SDS. | Стабильность белка высока на родной странице. |
Восстановление оригинального белка | |
Не возможно, так как это денатурировано на странице SDS. | Возможно на родной странице. |
SDS Page и Native Page - это два типа методов электрофореза в полиакриламидном геле, используемые для разделения белков. SDS Page обрабатывается моющим средством SDS. SDS придает белку общий отрицательный заряд, который затем приводит к денатурации белка. Следовательно, белки разделяются в зависимости от их молекулярной массы. В отличие от этого, метод Native Page не использует денатурирующий агент. Таким образом, белки либо разделены в зависимости от их размера или формы. В этом разница между страницей SDS и родной страницей..
1. «Принцип и метод электрофореза в полиакриламидном геле (SDS-PAGE)». Принцип и метод электрофореза в полиакриламидном геле (SDS-PAGE) | MBL Life Sience -ASIA-. Доступна здесь
2. «Родные гели». Альянс Белковые Лаборатории | Услуги по биофизической характеристике. Доступна здесь
1. «Электрофорез на SDS-странице» по счету Bensact в английской Википедии, (CC BY 3.0) через Commons Wikimedia
2. «Загрузите образец в лунку для электрофореза в полиакриламидном геле» By Blaz Nemec из Любляны, Словения (CC BY-SA 2.0) через Commons Wikimedia