Разница между страницей SDS и собственной страницей

Ключевая разница - SDS Page против Native страница
 

SDS и нативная страница представляют собой два типа методов электрофореза в полиакриламидном геле, используемые в молекулярной биологии. ключевое отличие между SDS Page и Native Page - тип используемого полиакриламидного геля. На странице SDS используется денатурирующий гель, поэтому молекулы разделяются в зависимости от их молекулярной массы. Напротив, в Native Page используются неденатурирующие гели. Следовательно, молекулы разделяются в зависимости от их размера, заряда и формы..

Электрофорез в полиакриламидном геле (Page) использует гель, полученный путем полимеризации акриламидных мономеров с метиленбисакриламидом. Полиакриламид является более жестким и более термостойким, чем агароза. Полиакриламидные гели имеют меньший размер пор, что обеспечивает эффективное разделение белков. Существует два основных типа настроек страницы, а именно: SDS Page и Native Page. Страница SDS или Электрофорез в полиакриламидном геле с натрий-додецилсульфатом разделяет белки на основе их молекулярного веса. Денатурирующие гели используются в SDS. Native Page использует неденатурирующие гели и разделяет белки в зависимости от их размера, заряда и формы (трехмерная конформация)..

СОДЕРЖАНИЕ

1. Обзор и основные отличия
2. Что такое SDS Page
3. Что такое Native Page
4. Сходства между SDS Page и Native Page
5. Сравнение бок о бок - страница SDS и собственная страница в табличной форме
6. Резюме

Что такое SDS Page?

SDS Page является наиболее распространенной электрофоретической техникой, используемой для разделения белков в зависимости от их молекулярной массы. Гель получают путем добавления SDS (додецилсульфата натрия), который является моющим средством. SDS протезирует белки в мономеры. SDS является анионным моющим средством. Следовательно, он добавляет чистый отрицательный заряд к белкам в широком диапазоне рН. Когда суммарный отрицательный заряд передается молекулам белка из-за изменения заряда, сложные структуры разрушаются. Благодаря отрицательному заряду, белки притягиваются к положительному концу. Таким образом, молекулы с более низкой молекулярной массой быстрее перемещаются по матрице геля и могут наблюдаться вблизи анода, тогда как белки с более высокой молекулярной массой наблюдаются ближе к лункам..

Рисунок 01: Страница SDS

Связывание SDS с полипептидной цепью пропорционально ее относительной молекулярной массе. Следовательно, молекулярная масса также может быть определена с помощью SDS. Окрашивание гелей SDS Page производится окрашиванием бромфеноловым синим. Область применения SDS-страниц в большей степени варьируется, когда ее можно использовать для оценки относительной молекулярной массы и для определения относительного содержания белков в белковой смеси. SDS Page также можно использовать для определения распределения белков в смеси белков. SDS Page также применяется для очистки и оценки белков. Он используется в качестве предварительной процедуры для вестерн-блоттинга и гибридизации, которая, в свою очередь, используется для картирования и идентификации белка..

Что такое Native Page?

Электрофорез в нативном полиакриламидном геле (Native Page) использует неденатурирующий гель. Следовательно, SDS или любой другой денатурирующий агент не добавляют в матрицу геля. В Native Page разделение белков основано на заряде и размере белка. Следовательно, подвижность белка зависит от заряда и размера белка.

Заряд белка зависит от боковых цепей аминокислот. Если боковые цепи заряжены отрицательно, белок получит общий отрицательный заряд, и наоборот. Белки сохраняют трехмерную конформацию благодаря сворачиванию, которое происходит. Складывание происходит из-за нескольких типов связей в белках, таких как дисульфидные связи, гидрофобные взаимодействия и водородные связи. Следовательно, если нативная страница переносится при нейтральном pH, белки будут разделены в соответствии с молекулярной формой белка. Следовательно, Native Page можно использовать в качестве чувствительного метода для определения изменения заряда или конформации белка..

Основным преимуществом нативной страницы является то, что белок, используемый для анализа страницы, может быть восстановлен в своем первоначальном состоянии после анализа страницы, так как белок не нарушается во время процесса. Native Page - метод с относительно высокой пропускной способностью, и стабильность белка повышена.

Рисунок 02: Родная страница

После завершения прогона геля Native Page гель можно наблюдать, окрашивая бромфеноловым синим или любым другим подходящим окрашивающим реагентом. Применение Native Page включает в себя разделение кислых белков, включая гликопротеины, такие как человеческий рекомбинантный эритропоэтин, или идентификацию белков, присутствующих в бычьем сывороточном альбумине (BSA)..

Каковы сходства между страницей SDS и собственной страницей?

  • Системы SDS Page и Native Page используют полиакриламидный гель в качестве матрицы геля..
  • Оба используются для разделения и идентификации белков.
  • Оба используют электрофоретическую подвижность для разделения соединений.
  • И то, и другое может быть выполнено в вертикальном или горизонтальном режиме (в основном в виде вертикальных настроек страницы, поскольку длина пробега больше).
  • Аппарат для электрофореза, включающий гелевый резервуар, расчески, источник питания необходим для работы обоих методов..
  • Визуализация геля может быть выполнена с помощью методов окрашивания в обоих методах.

В чем разница между страницей SDS и собственной страницей?

Страница SDS против родной страницы

Страница SDS или страница натрия-додецилсульфата разделяет белки в зависимости от их молекулярной массы и использует денатурирующий гель. Native Page использует неденатурирующие гели и разделяет белки в зависимости от их размера, заряда и формы (трехмерная конформация)..
 Тип геля
На SDS-странице используется денатурирующий гель. Неденатурирующий гель используется на родной странице.
Наличие SDS
SDS присутствует в качестве моющего средства для придания отрицательного заряда образцу на странице SDS. SDS нет на родной странице.
 Основа разделения 
Разделение белков зависит от молекулярной массы белка на странице SDS. Разделение зависит от размера и формы молекулы белка на нативной странице..
Стабильность белка
Стабильность белка низкая на странице SDS. Стабильность белка высока на родной странице.
Восстановление оригинального белка
Не возможно, так как это денатурировано на странице SDS. Возможно на родной странице.

Резюме - SDS Page против родного страница

SDS Page и Native Page - это два типа методов электрофореза в полиакриламидном геле, используемые для разделения белков. SDS Page обрабатывается моющим средством SDS. SDS придает белку общий отрицательный заряд, который затем приводит к денатурации белка. Следовательно, белки разделяются в зависимости от их молекулярной массы. В отличие от этого, метод Native Page не использует денатурирующий агент. Таким образом, белки либо разделены в зависимости от их размера или формы. В этом разница между страницей SDS и родной страницей..

Ссылка:

1. «Принцип и метод электрофореза в полиакриламидном геле (SDS-PAGE)». Принцип и метод электрофореза в полиакриламидном геле (SDS-PAGE) | MBL Life Sience -ASIA-. Доступна здесь
2. «Родные гели». Альянс Белковые Лаборатории | Услуги по биофизической характеристике. Доступна здесь  

Изображение предоставлено:

1. «Электрофорез на SDS-странице» по счету Bensact в английской Википедии, (CC BY 3.0) через Commons Wikimedia  
2. «Загрузите образец в лунку для электрофореза в полиакриламидном геле» By Blaz Nemec из Любляны, Словения (CC BY-SA 2.0) через Commons Wikimedia